福州左海湖细菌群落结构及菌群时空变化规律研究-生物学;微生物学专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 Classification Number：Q938.8 Unit Code: 10389 Security Level： Student ID: 1110517016 Thesis for Master’s Degree of Science Fujian Agriculture and Forestry University The bacterial community and its spatialtemporal dynamics in Lake Zuohai Subject Category: Science Primary Subject: Biology Secondary Subject: Microbiology Research Field: Microbial Ecology Postgraduate: Lanying Liu Supervisor: Prof. Zonghua Wang Prof. Yueren Li Submitted time: April, 2014 独创性声明 本人声明，所呈交的学位（毕业）论文，是本人在指导教师的指导下独立 完成的研究成果，并且是自己撰写的。尽我所知，除了文中作了标注和致谢中 已作了答谢的地方外，论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果。与我一 同对本研究做出贡献的同志，都在论文中作了明确的说明并表示了谢意，如被 查有侵犯他人知识产权的行为，由本人承担应有的责任。 学位（毕业）论文作者亲笔签名： 日期： 论文使用授权的说明 本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位（毕业）论文的规定，即学 校有权送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅; 学校可以公布论文的全部或 部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 保密，在 年后解密可适用本授权书。 □ 不保密，本论文属于不保密。 □ 学位（毕业）论文作者亲笔签名： 日期： 指导教师亲笔签名： 日期： 目 录 摘 要 I Abstract II 第一章 引言 1 1 湖泊水体细菌的生态功能 1 1.1 湖泊细菌的生产力 1 1.2 湖泊细菌参与的生物地球化学过程 1 2 细菌群落结构与多样性 3 2.1 不同湖泊生境细菌多样性的研究概况 3 2.2 细菌群落多样性的空间分布及季节性特征 6 3 湖泊细菌群落结构和多样性的研究方法 6 3.1 传统的微生物学技术 7 3.2 分子生物学技术 8 4 本论文的研究内容、目的和意义 14 第二章 左海湖水体细菌群落的时空演替 15 1 材料与方法 15 1.1 样品采集与处理 15 1.2 供试载体 15 1.3 培养基 15 1.4 生化试剂 15 1.5 PCR 引物 16 1.6 水体环境因子的测定 16 1.7 水体细菌的收集 16 1.8 水体细菌丰度的测定 17 TOC \o 1-1 \h \z \u HYPERLINK \l _TOC_250003 1.9 水体细菌基因组 DNA 的提取 17 HYPERLINK \l _TOC_250002 1.10 水体细菌 16S rRNA 基因 V3 区片段的扩增 18 HYPERLINK \l _TOC_250001 1.11 变性梯度凝胶电泳（DGGE） 18 HYPERLINK \l _TOC_250000 1.12 细菌 16S rRNA 基因 V3 区片段的回收及克隆 19 1.13 数据分析 21 2 实验结果 22 2.1 左海湖环境因子分析 22 2.2 左海湖细菌丰度的时空分布变化 25 2.3 DGGE 图谱分析 28 2.4 DGGE 图谱的聚类分析 30 2.5 左海湖细菌多样性分析 32 2.6 16S rRNA 基因序列及系统发育分析 34 2.7 左海湖细菌群落的时空变化分析 36 2.8 左海湖细菌群落组成与环境因子的相关性分析 37 3 讨论 40 3.1 左海湖细菌丰度的时空分布变化 40 3.2 左海湖细菌群落结构的时空分布变化 41 3.3 左海湖细菌群落结构与水质环境因子的相关性 42 第三章 左海湖水体细菌 16S rRNA 基因克隆文库构建及多样性分析 44 1 材料与方法 44 1.1 实验材料 44 1.2 样品的选择 44 1.3 水体样品细菌基因组 DNA 的提取 44 1.4 细菌 16S rRNA 基因全长片段的扩增 44 1.5 克隆文库的构建 45 1.6 细菌 16S rRNA 基因扩增片段的限制性酶切分析 45 1.7 细菌 16S rRNA 基因序列测定及相关分析 46 2 实验结果 48 2.1 细菌 16S rRNA 基因