利用基于SSR标记的MCID法鉴定72个柿地方品种.PDFVIP

植物遗传资源学报２０１８ꎬ１９(５):８９５￣９０３ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ＤＯＩ:１０.１３４３０/ ｊ.ｃｎｋｉ.ｊｐｇｒ.２０１７１２２６００１ 利用基于ＳＳＲ标记的ＭＣＩＤ法鉴定７２个柿地方品种 戚建锋ꎬ李晓鹏ꎬ王文然ꎬ贾海锋 (南京农业大学园艺学院ꎬ南京２１００９５) 　 　 摘要:应用基于ＳＳＲ分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(ＭＣＩＤꎬｍａｎｕａｌ ｃｕｌｔｉｖａｒ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｄｉａｇｒａｍ)对来源于中国各 地的７２ 个柿地方品种进行了鉴定ꎮ 结果表明ꎬ利用筛选出的６对引物进行ＰＣＲ扩增、再统计凝胶电泳特征性谱带ꎬ最后人工 绘制出品种树形鉴别图ꎬ可将７２ 个柿地方品种在分子水平上进行快速区分ꎮ 同时利用ＮＴＳＹＳ￣２１０ｅ软件进行聚类分析ꎬ通 过聚类分析树状图直观了解各品种间的遗传关系ꎬ在遗传相似系数为０６２左右时ꎬ可以分为３ 个类群ꎮ 所得的ＭＣＩＤ 图比聚 类树更具直观性与实用性ꎬ通过查阅ＭＣＩＤ 图可以快速获得鉴别这些地方品种所需要的引物以及依据的多态性谱带ꎮ 这对柿 种质资源的鉴定及促进柿产业的持续发展具有积极的意义ꎮ 关键词:柿ꎻ地方品种ꎻＳＳＲꎻ人工绘制植物品种鉴别图法(ＭＣＩＤ)ꎻ品种鉴定 Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ７２ Ｐｅｒｓｉｍｍｏｎ Ｌａｎｄｒａｃｅｓ ｂｙ Ｕｓｉｎｇ ＳＳＲ Ｍａｒｋｅｒｓ￣ｂａｓｅｄ ＭＣＩＤ Ｍｅｔｈｅｏｄ ＱＩ Ｊｉａｎ￣ｆｅｎｇꎬＬＩ Ｘｉａｏ￣ｐｅｎｇꎬＷＡＮＧ Ｗｅｎ￣ｒａｎꎬＪＩＡ Ｈａｉ￣ｆｅｎｇ (Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ ＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅꎬＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＮａｎｊｉｎｇ ２１００９５) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ａ ｍｅｔｈｏｄ ｆｏｒ ｖａｒｉｅｔｙ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｕｓｉｎｇ ａ ｍａｎｕａｌ ｃｕｌｔｉｖａｒ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｄｉａｇｒａｍ(ＭＣＩＤ)ｂａｓｅｄ ｏｎ ＳＳＲ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓｗａｓ ｄｅｐｌｏｙｅｄ ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｃｌａｒｉｆｙ ７２ ｐｅｒｓｉｍｍｏｎ ｌａｎｄｒａｃｅｓ ｉｎ Ｃｈｉｎａ.Ｂｙ ｕｓｉｎｇ ｓｉｘ ｐａｉｒｓ ｏｆ ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔｓ(ＳＳＲ)ｍａｒｋｅｒｓꎬｗｅ ｗｅｒｅ ａｂｌｅ ｔｏ ｃｌａｒｉｔｙ ｔｈｅ ｐｅｒｓｉｍｍｏｎ ｌａｎｄｒａｃｅｓ ａｔ ｔｈｅ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｌｅｖｅｌ ｔｈｒｏｕｇｈꎬａｎｄ ａｌｓｏ ｍａｎｕａｌｌｙ ｆｉｇｕｒｅｄ ｏｕｔ ｔｈｅ ｔｒｅｅ￣ｂａｓｅｄ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｃｈａｒｔｓ.Ｔｈｅ ｃｌｕｓｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｙ ｕｓｉｎｇ ＮＴＳＹＳ￣ ２１０ｅ ｓｏｆｔｗａｒｅｒｅｖｅａｌｅｄｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ａｍｏｎｇｖａｒｉｅｔｉｅｓ.Ｔｈｒｅｅ ｓｕｂｇｒｏｕｐｓｗｅｒｅａｓｓｉｇｎｅｄｗｉｔｈ ｔｈｅｇｅｎｅｔ￣ ｉｃ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ｃａ.０６２.Ｔｈｅ ｏｂｔａｉｎｅｄ ＭＣＩＤ ｍａｐ ｉｓ ｉｎｔｕｉｔｉｖｅ ａｎｄ ｕｓｅｒ￣ｆｒｉｅｎｄｌｙ ｉｎ ｃｏｎｔｒａｓｔ ｔｏ ｔｈｅ ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ ｔｒｅｅ.Ｂｙ ｒｅｆｅｒｒｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅ ＭＣＩＤ ｍａｐꎬｔｈｅ ｐｒｉｍｅｒｓ ａｎｄ ｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｓｗｅｒｅ ａｖａｉｌａｂｌｅ.Ｔｈｕｓꎬｔｈｉｓｗｏｒｋ ｐｒｏ￣ ｖｉｄｅｄ ａ ｓｏｌｕｔｉｏｎ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｔｈｅ ｐｅｒｓｉｍｍｏｎ ａｃｃｅｓｓｉｏｎｓꎬｗｈｉｃｈ ｍｉｇｈｔ ｂｅ ｈｅｌｐｆｕｌ ｉｎ ｓｕｓｔａｉｎａｂｌｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｐｅｒｓｉｍｍｏｎ ｉｎｄｕｓｔｒｙ. Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ:ｐｅｒｓｉｍｍｏｎꎻｌａｎｄｒａｃｅꎻＳＳＲꎻｍａｎｕａｌｃｕｌｔｉｖａｒｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｄｉａｇｒａｍ(ＭＣＩＤ)ｍｅｔｈｏｄꎻｃｕｌｔｉｖａｒｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ 柿属于柿科(Ｅｂｅｎａｃｅａｅ)柿属(Ｄｉｏｓｐｙｒｏｓ