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人工智能技术在生物信息学中的应用研究 刘滨 内容 生物信息学概述 生物知识 DNA介绍 蛋白质介绍 人工智能和自然语言处理技术在生物信息学中的应用 蛋白质序列和自然语言的相似性 蛋白质相互作用位点预测 远程同源性和折叠检测 资源 数据库 工具 研究方向 DNA介绍 碱 基 碱 基 配 对 DNA的空间结构 蛋白质介绍 20种标准氨基酸的英文简写 肽键 本实验室的人工智能技术和自然语言处理技术在生物信息学中的应用 采用Ngram寻找蛋白白质序列和自然语言的相似性 采用条件随即域（CRF）解决蛋白质相互作用位点预测问题。 采用N-gram, binary profile和N-nary profile模型结合支持向量（SVM）机解决蛋白质远程同源性和折叠识别的问题。 采用潜在语义分析（LSA）提高远程同源性检测效果。 蛋白质序列和自然语言的相似性 蛋白质序列和自然语言的相似性 Dong et al. N-gram Statistics and Linguistic Featrues Analysis of Whole Genome Protein Sequences. Journal of Harbin Institute of Technology. 2004 在此论文中，探索了蛋白质和自然语言之间的关系。 N-gram 例子： SVYDA 其中包含的3-gram为： SV