图的顶点着色问题的DNA算法-电子学报.PDF

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图的顶点着色问题的DNA算法-电子学报

第 4 期 电  子   学   报 Vol . 31  No . 4  2003 年 4 月 ACTA ELECTRONICA SINICA Apr .  2003   图的顶点着色问题的DNA 算法 1 2 高  琳 ,许  进 ( 1. 西安电子科技大学雷达信号处理国家重点实验室 ,陕西西安 710071 ;2 . 华中科技大学系统科学研究所 ,湖北武汉 430074)   摘  要 :  图的顶点着色问题是指无向图中任意两个相邻顶点都分配到不同的颜色 ,这个问题是著名的NP完全 问题 ,没有非常有效的算法. 但在 1994 年 Adleman[ 1] 首次提出用 DNA 计算解决 NP完全问题 ,设计出一种全新的计算 模式 —模拟生物分子 DNA 的结构并借助于分子生物技术进行计算 ,使得 NP完全问题的求解可能得到解决. 本文首先 提出了基于分子生物技术的图的顶点着色问题的DNA 算法 ,算法的关键是对图中的顶点和顶点的颜色进行恰当的编 码 , 以便于使用常规的生物操作及生物酶完成解的产生及最终解的分离 ,依据分子生物学的实验方法 ,本文提出的算 法是有效和可行的;其次指出了该算法的优点、存在的问题及将来进一步的研究方向. 关键词 :  DNA 计算 ; NP完全问题 ; 顶点着色问题 ; 限制酶 中图分类号 :  TP18    文献标识码 :  A    文章编号 : (2003) A DNA Algorithm for Grap h Vert ex Coloring Problem 1 2 GAO Lin ,XU Jin ( 1. N ational Key L ab. of Radar Signal Processing , Xidian Univ , Xi ’an , Shanxi 710071, China ; 2. System Science Research Institute , Huazhong University of Science and Technology , Wuhan , Hubei 430074 , China) Ab stract :  Given an undirected graph ,the vertex coloring problem is to assign a different color for vertex mutually adj acent . This problem is an NPcomplete one and has no effective solving method. But Adleman[ 1] introduced firstly the DNA computing in 1994 ,with which the NPcomplete problems are likely to be solved. DNAbased algorithm simulates molecular biology structure of D

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