河蓝蛤属贝类生物学性状及基于线粒体DNA的分子遗传学分析-水产养殖专业论文.docxVIP

上海海洋大学硕士学位论文 上海海洋大学硕士学位论文 PAGE PAGE 2 河蓝蛤(Potamocorbula romuscula )4 个种共 40 个个体的线粒体 COI 和 16S rRNA 基 因片段进行了扩增和测序，经过筛选和剪切，分别得到长度为 650 bp 和 450 bp 的 片段。序列分析显示，序列的碱基组成中 G+C 含量较低，16S rRNA 基因种间和 种内的变异较低，COI 基因片段种内和种间的变异较高。以沙海螂(Mya arenaria) 为外群，用 MEGA4.0 软件中的 NJ 法构建了系统进化树，通过遗传距离和系统进 化树可以看出四种河蓝蛤未能达到不同种之间显著的遗传分化，这一结果和传统 分类学结果有所差别。 4.基于线粒体 COI 和 16S rRNA 基因分析黑龙江河蓝蛤 3 个不同地理群体的遗 传多样性：采用通用引物对辽宁盘锦、辽宁大连、山东日照的 3 个地理群体黑龙 江河蓝蛤 COI 和 16S rRNA 序列进行扩增、测序分析，得到 30 条 658bp 的 COI 基 因部分序列和 27 条 450bp 的 16S rRNA 基因部分序列。其中 COI 和 16S rRNA 基 因部分序列 T、C、A、G 和 A+T 的平均含量分别为 45.4%和 32.0%、13.5%和 13.3%、 20.7%和 29.3%、20.4%和 25.3%、66.1%和 61.3%，AT 含量高于 GC 含量。在 COI 和 16S rRNA 基因序列中分别检测到了 24 个单倍型、43 个核苷酸多态位点和 9 个 单倍型、19 个核苷酸多态性位点。AMOVA 分析表明，三个群体间 COI 和 16S rRNA 部分基因总遗传分化系数分别为 Fst = 0.0090(P0.001)和 Fst = 0.0674(P0.001)，群 体内遗传分化远大于群体间、群体内存在较高的遗传分化。用 NJ 法构建分子进化 树，3 个地理群体的黑龙江河蓝蛤聚为一个族群，有少数个体和其他群体的个体聚 在一起。 5.光滑河蓝蛤 3 个地理群体 COI 基因遗传多样性研究：采用通用引物对山东 东营、潍坊、日照的 3 个地理群体的光滑河蓝蛤 COI 序列进行扩增、测序分析， 得到 30 条 665bp 的 COI 基因部分序列。其中 COI 基因部分序列 T、C、A、G 和 A+T 的平均含量分别为 46.2%、13.3%、21.7%、18.8%及 67.9%，A+T 含量高于 G+C 含量、这与软体动物门其它动物的 COI 基因的研究结果相符。在 COI 基因序 列中检测到了 18 个单倍型、31 个核苷酸多态位点。三个群体间的遗传分化较小， 用 NJ 法和 UPGMA 法构建系统发育进化进化树，3 个地理群体的光滑河蓝蛤互相 聚在一起，没有出现分化。 上述研究结果为今后开展河蓝蛤的育种和分类研究提供了翔实的数据，为以 后性状研究和分子遗传学研究打下一定基础。 关键词：河蓝蛤属，表型，遗传多样性，COI，16S rRNA Studies on Biological Traits and Molecular Genetics Based on Mitochondrial DNA of Potamocorbula ABSTRACT The clams of Potamocorbula with high economic value are widely distributed along the coastal areas of China. But there is few studies on population genetics and molecular biology research, most of them were concentrated in the nutrition and breeding research. Taking wild river blue clams as the material, we firstly explored the relationship between the phenotypic traits and weight of Potamocorbula laevis, and analyzed its chromosome karyotype. In this study, genetic diversity and classification status of four species of Potamocorbula are also analyzed based on mitochondrial DNA COI and 16S rRNA. The