基于HPLC-MS冠心病代谢组学及其与肠道菌群宏基因组学关联的研究Based on HPLC - MS metabonomics and coronary hart disease associated with intestinal flora macro genomics research.docx
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基于HPLC-MS冠心病代谢组学及其与肠道菌群宏基因组学关联的研究Based on HPLC - MS metabonomics and coronary hart disease associated with intestinal flora macro genomics research
解放军医学院博士学位论文英文缩略词表
解放军医学院博士学位论文
英文缩略词表
缩写 英文全称 中文全称
CHD Coronary heart disease 冠心病
HCA Hierarchical cluster analysis 聚类分析
PCA Principal component analysis 主成分分析法
PLS-DA Partial least squares discriminant偏最小二乘判别分析法
analysis
GlcNAc-·6--P N··Acetyl··D··glucosamine N.乙酰.D一葡萄糖胺.6一
6-phosphate 磷酸
MS mass spectrometry 质谱
NMR nuclear magnetic resonance 高分辨核磁共振
LC-MS Liquid chromatography—mass 液态色谱.质谱联用法
spectrometry
HPLC—MS High performance liquid 高效液相色谱.质谱联
chromatography-mass spectrometry 用
m/s mass··to·-charge ratio 质荷比
ROC receiver operating characteristic 受试者工作特征
万方数据
解放军医学院博士学位论文作
解放军医学院博士学位论文
作 者:李蕊君 学科专业:老年医学 导 师:何昆仑
基于HPLC-MS冠心病代谢组学及其与肠道菌群宏基因组学关联的 研究
中文摘要
目的:冠心病诊治及预防亟需发掘新的靶点及方向。本研究旨在通过代谢组 学技术筛选冠心病特异性代谢标志物。并联合宏基因组学技术寻找肠道菌群参与 冠心病患者代谢的证据、特异性菌群及关联代谢标志物。
方法:(1)通过采用高效液相色谱质谱联用技术对40名冠心病患者和43名 健康对照者的血浆样本进行非靶向代谢组学研究,结合单变量统计和多变量统计 方法筛选出可以明确区分冠心痛患者与健康对照人群的代谢物、运用聚类分析方 法区分不同表型下代谢物的变化情况。进一步追溯这些代谢物的来源及所涉及的 功能通路,找出冠心病患者特征性的代谢标志物,从而建立研究冠心病患者代谢 特征及代谢标志物的分析方法。(2)通过采用上述方法,对另外59名冠心病患者 和43名健康对照者的血浆和尿液进行代谢分析,筛选出具有良好诊断能力的共同 代谢标志物,结合宏基因组学技术与肠道菌群的物种、功能水平进行关联,发现 与冠心病相关的特异性菌群。
结果:(1)本实验通过高效液相色谱质谱联用技术对样本进行非靶向代谢组 学研究,结合多种统计方法筛选具有良好诊断能力的代谢物,运用聚类分析等方 法区分不同袁型下代谢物变化情况,进一步通过代谢物数据库追溯代谢物来源和 涉及的通路,最终联合宏基因组学技术与肠道菌群进行关联分析,从而建立了冠 心病代谢物研究及与菌群关联分析的方法。(2)通过上述方法对40名冠心病患者 和43名健康对照者的血浆样本进行分析,发现7种代谢物(1一萘酚、2.萘酚、甲
2
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基衣康酸、N.乙酰.D.葡萄糖胺一6一磷酸、L.肉毒碱、二甲酯马来酸、苯丙酮酸)可 以显著区分冠心病患者和健康对照者.并发现N.乙酰.D.葡萄糖胺.6.磷酸和L一肉 毒碱可能与肠道菌群参与的代谢相关。(3)对59名冠心病患者和43名健康对照者 的血浆和尿液进行代谢分析,筛选出具有良好诊断能力的共同代谢标志物N一乙酰
.D.葡萄糖胺.6.磷酸和甘露醇,并发现肠道菌群Clostridium sp.册门与N.乙酰.D一
葡萄糖胺-6-磷酸、甘露醇显著正相关.而Streptococcus sp.M334和Streptococcus sp.
M143则与甘露醇显著正相关。 结论:冠心病患者存在代谢紊乱,肠道菌群与其有关,发现的代谢物和显著
相关的肠道菌群可能成为诊断冠心病的潜在标志物和治疗干预靶点,另外本研究 中所采用的研究方法或可为今后包括冠心病在内心血管疾病代谢及肠道菌群研究 提供借鉴。
关键词:冠心病,肠道菌群,代谢组学,宏基因组,关联研究
3
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解放军医学院博士学位论文HPLC—MS
解放军医学院博士学位论文
HPLC—MS based metabolomics and metagenomics analysis of microbial metabolites associated with coronary heart disease
Abstact
objective:Coronary heart disease(CHD)is t
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