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第42 卷 第 3 期 水 产 学 报 Vol. 42, No. 3
2018 年 3 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Mar., 2018
文章编号: 1000-0615(2018)03-0305-09 DOI: 10.11964/jfc.20170310750
大口黑鲈肌球蛋白重链基因SNPs的筛选及与生长性状的关联
1,2 1 1 1 3 1*
李胜杰 , 姜 鹏 , 樊佳佳 , 白俊杰, 李 锐 , 朱新平
(1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与
养殖重点实验室,广东 广州 510380;
2. 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;
3. 内江师范学院, 四川 内江 641100)
摘要:肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了研究
肌球蛋白重链(MYH)基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,本研究采用PCR技术扩
增得到编码区序列全长为9759 bp 的大口黑鲈MYH 基因,该基因包含37个外显子和36个内
含子,编码1940个氨基酸。采用直接测序法在MYH 基因上筛选到8个单核苷酸多态性标
记(SNP)位点(A-305G、G-558C、A-2784C 、A-2816G 、T-4765A 、C-6206T、C-6811T和G-
6935T) ,有4个位于外显子上,其中2个属于同义突变。用SNaPshot方法对从同批繁殖、
同塘养殖的大口黑鲈“ 优鲈1号” 群体中随机选取的430 尾个体中各位点的基因型进行检
测。结果显示,内含子上的A-2784C和A-2816G位点完全连锁,所有位点在大口黑鲈“ 优
鲈1号” 群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.635、
0.406和0.373 ,仅C-6206T 、C-6811T和T-4765A位点的基因型频率分布符合Hardy-Wein-
berg定律。采用一般线性模型分析各位点与大口黑鲈生长性状之间的相关性,研究发现,
C-6811T位点CC基因型个体的体质量和全长显著大于TT基因型,CC基因型个体的体高和
尾柄长显著大于CT和TT基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著
差异。C-6811T位点与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。
关键词: 大口黑鲈;肌球蛋白重链基因;单核苷酸多态性标记(SNP) ;生长性状;关联分析
中图分类号: Q 785 ;S 917.4 文献标志码: A
[4]
肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,广 长有关 。虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 、玻璃梭吻
[1]
泛存在于非肌细胞中 。肌球蛋白是一种多功能
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