基于SNP特征的样本分类-计算机应用技术专业论文.docxVIP

Abstract Single Nucleotide Polymorphism (SNP) is a genetic marker which commonly exists in human genome. It is mainly referred to DNA polymorphism caused by the single nucleotide variation at genome level. As a genetic marker, SNP is more reliable for disease prediction, diagnosis and cure. So the study of SNP has very important meaning. This paper mainly studies the classification performance of SNPs and its probabilities of disease-producing. First, we study the performance of SNPs. Next, we study the classification performance of disease probabilities obtained from the models. This is from the view of model to study the classification. With this aim, three classifiers were introduced which will be used to classify the samples through the SNPs and probabilities. Results from the experiments indicate that SNPs from the models have a best classification performance for the samples; the classification performance of the probabilities abtained from the models is up the accuracy of the probabilities and the taining of classifier. Besides, from this paper, we can get that the true disease-related SNPs should be found in order to do a best disease modeling of SNPs. Keywords: SNP Classification Disease-caused Models 西安电子科技大学 独创性（或创新性）声明 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究 成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢中所罗列的内容以外，论文中不 包含其他人已经发表或撰写过的研究成果；也不包含为获得西安电子科技大学或 其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做 的任何贡献均已在论文中做了明确的说明并表示了谢意。 申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担一切相关责任。 本人签名： 日期 西安电子科技大学 关于论文使用授权的说明 本人完全了解西安电子科技大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生 在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属西安电子科技大学。本人保证毕业 离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位仍然为西安电子科技大学。学 校有权保留送交论文的复印件，允许查阅和借阅论文；学校可以公布论文的全部 或部分内容，可以允许采用影印、缩印或其它复制手段保存论文。（保密的论文在 解密后遵守此规定） 本学位论文属于保密在 年解密后适用本授权书。 本人签名： 日期 导师签名： 日期 第一章 绪论 1.1 SNP 背景知识介绍 SNP 介绍 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP),主要是指在基因组水平 上由单个核苷酸的变异所引起的 DNA 序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常 见的一种。占所有已知多态性的 90%以上[1]。SNP 在人类基因组中广泛存在，平 均每 500～1000 个碱基对中就有 1 个，估计其总数可达 300 万个甚至更多。 SNP 所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异，这种变异可由单个碱基的转 换(transition)或颠换(transversion)所引起，也