系统生物学 第五讲 代谢组学.pptxVIP

第五讲 代谢组学;植物产生次生代谢物适应不良自然环境;次生代谢与植物发育有着不可分割的联系;Center for Signal Transduction Metabolomics;人体需要的特殊营养物质主要来源于植物;Center for Signal Transduction Metabolomics;生长发育;主要内容;;代谢组的概念;代谢组学的概念;代谢组学的发展过程;代谢组学的创建;1999 年Jeremy K. Nicholson 等人提出metabonomics 的概念,并在疾病诊断、药物筛选等方面做了大量的卓有成效的工作 ,使得代谢组学得到了极大的充实,同时也形成了当前代谢组学的两大主流领域：metabolomics 和metabonomics。 metabolomics 是通过考察生物体系受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后) 代谢产物的变化或其随时间的变化, 来研究生物体系的代谢途径的一种技术。metabonomics 是生物体对病理生理刺激或基因修饰产生的代谢物质的质和量的动态变化的研究。前者??般以细胞做研究对象,后者则更注重动物的体液和组织。 ;代谢组学与其他组学关系 ;基因组的变化不一定能够得到表达，从而并不一定对系统产生影响； 某些蛋白的浓度会由于外部条件的变化而升高，但由于这个蛋白可能不具备活性，从而也不对系统产生影响； 由于基因或蛋白的功能补偿作用，某个基因或蛋白的缺失会由于其他基因或蛋白的存在而得到补偿，最后反应的净结果为零； 小分子的产生和代谢才是这一系列事件的最终结果，它能够更准确的反映生物体系的状态。 ;代谢组学优点;生物体系的代谢产物分析的四个层次;代谢组学的内容和特点;代谢组学的内容和特点;代谢组学的研究策略;代谢组学的研究策略;代谢组学的研究策略;代谢组学的研究策略;广泛靶向代谢组学;代谢组学研究的主要应用领域;健康与疾病诊断;代谢组学在疾病研究中的应用;肝病标志物;代谢组学在肿瘤研究中的应用;;代谢组学在其他疾病研究中的应用;代谢组学在毒理学中的应用;;;代谢组学在药物研发中的应用; 对候选药物进行大规模筛选需要多家机构进行科研合作, 在这方面, 大制药公司和伦敦帝国学院发起成立了毒物代谢组联盟(Consortium for Metabonomic Toxicology, COMET)计划。 该联盟开发新的代谢组数据采集、分析方法, 利用NMR对大鼠和小鼠尿液、血清进行代谢物分析, 对候选药物进行临床前毒副效应研究。 评估分析仪器以及生物体的差异对结果的影响, 提高结果的可重复性, 其最终目的在于建立药物毒副作用的专家预测系统, 并对种属间药物毒性差异进行研究。;;营养学领域;代谢组学在植物的应用;代谢组学研究流程;代谢组学各分析流程技术;代谢组学的研究流程;Center for Signal Transduction Metabolomics;核磁共振技术（NMR）;色谱-质谱联用;毛细管电泳;代谢组学的技术平台; ;代谢组学研究步骤;生物样品收集与预处理;样品采集;样品预处理;数据采集（分析技术平台）;色谱法:一种分离技术 原理： 使混合物中各组分在两相间进行分配,其中一相是不动的(固定相),另一相(流动相)携带混合物流过此固定相,与固定相发生作用,在同一推动力下,不同组分在固定相中滞留的时间不同,依次从固定相中流出,又称色层法,层析法。 分类： (1)气相色谱和液相色谱 (2)柱色谱,纸(PC)色谱,薄层色谱(TLC) (3)吸附色谱,分配色谱,离子交换色谱,排阻色谱(物理化学原理) ;气相色谱（Gas Chromatography）;气相色谱固定相 1. 气-固固定相 气固色谱固定相通常是具有一定活性的固体吸附剂细小颗粒，常见的有：活性炭，三氧化二铝，硅胶，分子筛，高分子多孔微球（GDX系列）等。 2. 气-液固定相 气液色谱固定相是以一种惰性固体微粒作支持剂（称其为担体或载体），在其表面涂敷上一高沸点的物质（其在色谱分离操作温度下呈液态，称其为固定液）而构成。 ; 当气化的组分与气相和固定相共存时，它就根据对两相相对吸附性能的不同而在两相间进行分配。 吸附性能：可以是溶解度，挥发性，极性，特殊的化学相互作用，或其他任何存在于样品组分间的性质差异。 ;气相色谱（GC）基本构造;气相色谱仪的组成及各部分的作用;4、检测系统 检测器，控温装置 检测恒温箱中的温度，一般选择与柱温相同或略高于柱温。 ;检 测 器;检测器有多种类型的检测器可供选择，但是所有的检测器的功能都是相同的： ;微量注射器：0.1，1，5，10，50 μL;色 谱 柱;氢火焰离子化检测器（flame ionizat