甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析-广东农业科学.PDFVIP

144 广东农业科学 2014 年第 12 期 甜瓜α- 甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析 乌斯呼吉日嘎拉 赵爱奇 莘少红 郝金凤 哈斯阿古拉 内蒙古大学生命科学学院/ 内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 内蒙古 呼和浩特 010021冤 摘要 琢- 露糖苷酶(琢-mannosidases, 琢-Man)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶遥 通过已公布的甜瓜基因 组数据库预测琢-Man 基因家族成员袁其蛋白序列都含有完整的Glyco_ hydro_ 47 或 Glyco_hydro_38 保守结构域遥 再将 筛选出的成员与拟南芥尧大豆尧番茄尧可可树尧葡萄尧黄瓜尧马铃薯尧谷子的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比 对袁建立系统发生树和保守基序的预测分析遥 结果表明袁甜瓜基因组中含有 8 个 琢-man 基因袁分为 玉类和域类袁并分 成 5 个亚族遥 同一类成员的蛋白结构域具有较高相似性与保守性袁并且大部分成员基序的顺序和种类相同袁不同类 的成员之间基序差距较大遥 对甜瓜 琢- 露糖苷酶基因家族的系统分析鉴定袁有助于甜瓜 琢- 露糖苷酶基因克隆和 功能的进一步研究袁为研究其他植物 琢- 露糖苷酶基因家族的功能和进化提供参考依据遥 关键词 甜瓜曰琢- 露糖苷酶曰 进化分析曰 生物信息学 中图分类号 Q941 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2014冤12-0144-06 Genome-wide analysis of -mannosidases family genes in Cucumis melo Usukhj argal, ZHAO Ai-qi, SHEN Shao-hong, HAO Jin-feng, HASI Agula (Colle ge of Life Sc ie nce s, Inne r Mongolia Univ e rs ity/Inne r Mongolia Key Laboratory of He rbage Ende mic Crop Biotec hnology, Hohhot 010021, China) A bstract: 琢-mannosidases (琢-Man), one group of glycosidases, have been universally distributed among most types of liv ing organisms. Based on the published database of melon (Cuc umis me lo), we found the 琢-Man family genes containing complete Glyco_ hydro_ 47 or Glyco_hydro_ 38 domain. These protein sequences were analyzed by multi-sequence aligned, w hich are similar in A rabidops is thaliana, G lyc ine max, Solanum lyc ope rs ic um, Theobroma c ac ao, V itis v inife ra, C. sativ us, S. tuberos um and Se taria italic. And the structure evolution relati