甘蔗MOC1基因ScMOC1的克隆与表达分析-植物遗传资源学报.PDFVIP

植物遗传资源学报２０１７ꎬ１８(４):７３４￣７４６ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ＤＯＩ:１０.１３４３０/ ｊ.ｃｎｋｉ.ｊｐｇｒ.２０１７.０４.０１７ 甘蔗ＭＯＣ１基因(ＳｃＭＯＣ１)的克隆与表达分析 李旭娟ꎬ李纯佳ꎬ徐超华ꎬ刘洪博ꎬ吴转娣ꎬ林秀琴ꎬ陆　 鑫ꎬ毛　 钧ꎬ字秋艳ꎬ刘新龙 (云南省农业科学院甘蔗研究所/ 云南省甘蔗遗传改良重点实验室ꎬ开远６６１６９９) 　 　 摘要:ＭＯＮＯＣＵＬＭ １(ＭＯＣ１)基因在植物腋分生组织和腋芽的形成中发挥重要作用ꎬ是植物分蘖关键调控基因ꎮ 本研究 利用同源基因克隆法结合ＲＴ￣ＰＣＲ、ＲＡＣＥ技术从甘蔗品种ＲＯＣ２２ 中克隆获得ＭＯＣ１ 的同源基因ꎬ命名为ＳｃＭＯＣ１ꎮ 生物信息 学分析发现该基因的ｃＤＮＡ序列包含一个长度为１２９９ ｂｐ 的开放阅读框ꎬ编码４３２ 个氨基酸残基组成的含有ＧＲＡＳ保守结构 域的非分泌蛋白ꎬ其分子量为４５４３ ｋＤꎬ理化等电点ｐＩ 为６９８ꎮ 序列比对分析显示ＳｃＭＯＣ１与高粱(Ｓｏｒｇｈｕｍ ｂｉｃｏｌｏｒ(Ｌ ) Ｍｏｅｎｃｈ)、赖草(Ｌｅｙｍｕｓ ｓｅｃａｌｉｎｕｓ (Ｇｅｏｒｇｉ)Ｔｚｖｅｌ )、水稻(Ｏｒｙｚａｓａｔｉｖａ Ｌ )等禾本科植物同源蛋白氨基酸序列一致性较高ꎻ系统 进化树分析显示其与高粱、小米草(Ｓｅｔａｒｉａ ｉｔａｌｉｃａ(Ｌ )Ｐ.Ｂｅａｕｖ )、玉米(Ｚｅａ ｍａｙｓ Ｌ )等禾本科植物ＭＯＣ１ 同源蛋白亲缘关系 最近ꎻＳｃＭＯＣ１在甘蔗品种ＲＯＣ２２ 中的序列变异分析发现ꎬ３０ 个克隆得到的序列中共有４６ 个ＳＮＰ位点和２９ 处ＩｎＤｅｌ位点ꎬ其 中１个位点发生的单个碱基缺失和另一个位点的４ 个碱基插入是造成基因编码蛋白序列变化的主要原因ꎮ 中性检测表明ꎬ ＳｃＭＯＣ１在ＲＯＣ２２ 中遵循中性进化模型ꎮ 采用实时荧光定量ＰＣＲ分析ＳｃＭＯＣ１在甘蔗品种ＲＯＣ２２分蘖期不同组织部位(根、 茎、叶、分蘖芽、叶鞘、生长点)、茎尖生长点和不同发育阶段腋芽(幼嫩腋芽、半大腋芽、较大腋芽、成熟休眠腋芽)的表达特征ꎬ 结果显示ＳｃＭＯＣ１在分蘖期的ＲＯＣ２２ 中的表达具有组织特异性ꎬ在生命活跃的茎尖生长点处表达量最高ꎻ在腋芽形成发育过 程中该基因表达总体呈现出“升￣降￣升￣降”的趋势ꎬ说明ＳｃＭＯＣ１基因可能在甘蔗腋芽形成发育阶段中发挥作用ꎮ 以上研究 可推测ＳｃＭＯＣ１在甘蔗的分蘖性状调控上扮演重要的角色ꎮ 本研究为ＳｃＭＯＣ１ 的功能研究及其在甘蔗产量分子辅助育种中的 利用奠定基础ꎮ 关键词:甘蔗ꎻ分蘖ꎻＭＯＣ１基因ꎻ序列变异分析ꎻ表达分析 Ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ＭＯＣ１ Ｇｅｎｅ (ＳｃＭＯＣ１)ｉｎ Ｓｕｇａｒｃａｎｅ(Ｓａｃｃｈａｒｕｍ ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ) ＬＩ Ｘｕ￣ｊｕａｎꎬＬＩ Ｃｈｕｎ￣ｊｉａꎬＸＵ Ｃｈａｏ￣ｈｕａꎬＬＩＵ Ｈｏｎｇ￣ｂｏꎬＷＵ Ｚｈｕａｎ￣ｄｉꎬＬＩＮ Ｘｉｕ￣ｑｉｎꎬ ＬＵ ＸｉｎꎬＭＡＯＪｕｎꎬＺＩ Ｑｉｕ￣ｙａｎꎬＬＩＵ Ｘｉｎ￣ｌｏｎｇ (Ｓｕｇａｒｃａｎｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ＩｎｓｔｉｔｕｔｅꎬＹｕｎｎａｎＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ/ Ｙｕｎｎａｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｕｇａｒｃａｎｅ Ｇｅｎｅｔｉｃ ＩｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔꎬＫａｉｙｕａｎ６６１６９９) Ａｂｓｔｒａｃｔ:ＭＯＮＯＣＵＬＭ １(ＭＯＣ１)ꎬａ ｇｅｎｅ ｔｈａｔ ｉｓ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｉｎ ｔｈｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｔｉｌｌｅｒｉｎｇꎬｗｈｉｃｈ ｐｌａｙｓ ａ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｔｈｅ ｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ ａｘｉｌｌａｒｙ ｍｅｒｉｓｔｅｍ ａｎｄ ａｘｉｌｌａｒｙ ｂｕｄ.Ｉｎ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙꎬｔｈｅ ｈｏｍｏｌｏｇ ｏｆ ＭＯＣ１ ｗｈｉｃｈ ｎａｍｅｄ ＳｃＭＯＣ１ ｗａｓ ｃｌｏｎｅｄ ｆｒｏｍ ｓｕｇａｒｃａｎｅ ｖａｒｉｅｔｙ ＲＯＣ２２ ｂｙ ａ ｓｅｒｉｅｓ ｏｆ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ｉｎｃｌｕ