第十一章微作生物的分类和鉴定.pptVIP

三域学说及其生物进化谱系树 第四节 微生物的鉴定 主要步骤：纯化、测定一系列必要的指标、查找权威性鉴定手册 鉴定技术的不同水平： 细胞的形态和习性 细胞组分水平 蛋白质水平 基因或DNA水平 数值分类法 即统计分类法，在200年前M. Adanson（1727~1806，法国植物学家）发表的分类原理基础上结合现代计算机技术发展而来的。 主要观点： 在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类所依据的性状越多，其分类效果也越好； 顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权的； 任何两分类实体间的整体相似性，都是由每一对的相似性计算而来的；能够由类群间相似性的差异识别不同的分类实体； 数值分类的基本步骤 计算两菌株间的相似系数 Ssm = SJ = 列出相似度矩阵 将矩阵图转换成树状图 分子杂交可在DNA与DNA、RNA与RNA或RNA与DNA的二条单链之间进行。 用分子杂交进行定性或定量分析的最有效方法是将一种核酸单链用同位素或非同位素标记成为探针，再与另一种核酸单链进行分子杂交。 3.电子杂交 随着微生物基因信息，特别是全基因组完全测序的不断增加，我们可以通过各种计算机软件对不同物种的遗传信息进行直接比较，从而分析不同微生物间的亲缘关系。 如果给予有关进化途径和机制的某些假定，可以从组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生