咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式-北京大学.PDF

物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) August Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27 (8), 1831-1838 1831 [Article] 咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用 方式的分子模拟 申 涛1 杜凤沛1 刘 婷1 姚广伟1 吴 峥1 方萌萌1 徐筱杰2 路慧哲1,* 1 2 ( 中国农业大学理学院, 北京100193; 北京大学化学与分子工程学院, 北京100871) 摘要: 国际上依据咪唑甘油磷酸酯脱水酶(IGPD)底物结构筛选, 成功获得了一系列含氮杂环磷酸酯类化合物 作为IGPD 抑制剂, 然而IGPD 与含氮杂环磷酸酯类抑制剂间的作用模式尚不清楚. 本研究利用Gaussian 03 程序, 基于密度泛函理论B3LYP 方法, 选择6-31G**基组优化含氮杂环磷酸酯类化合物, 在确定其稳定构象的 基础上利用分子对接、力学优化构建IGPD 与其含氮杂环磷酸酯类抑制剂相互作用的复合物结构, 基于化合物 的电子结构(前线轨道能级及组成、原子电荷、自然键轨道等)、复合物的空间结构(抑制剂识别IGPD 的功能域、 分子间氢键、van der Waals 相互作用等)探讨了IGPD 与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式, 确定了含氮杂环 电荷分布、磷酸根离子电荷分布、前线轨道LUMO 能级是影响抑制剂活性的内在因素, 为进一步筛选、优化高效 的新型除草剂提供了重要信息. 关键词: 咪唑甘油磷酸酯脱水酶; 抑制剂; 分子对接; 力学优化; 密度泛函理论; 前线轨道 中图分类号: O641 Molecular Simulation of the Interaction between Imidazole Glycerol Phosphate Dehydrase and Nitrogen-Containing Heterocyclic Phosphate Inhibitors SHEN Tao1 DU Feng-Pei1 LIU Ting1 YAO Guang-Wei1 WU Zheng1 FANG Meng-Meng1 XU Xiao-Jie2 LU Hui-Zhe1,* 1 ( Institute of Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, P. R. China; 2Institute of Chemistry and Molecular Engineering, Peking University, Beijing 100871, P. R. China) Abstract: A series of nitrogen-containing heterocyclic compounds as