基于数据分析探索API中内含子microRNA与PML-RARu组成的调控环路.PDFVIP

海南医学院学报 2012，18(9) JournalofHainanMedicalUniversity 1157 网络出版地址 ：http：／／ki．net／kcms／detail／46．1049．R0856．011．html 基于数据分析探索 APL中内含子 microRNA与 PML—RARa组成的调控 环路 涂序辉，王侃侃 ，张 济 (上海交通大学医学院附属瑞金医院，上海市血液学研究所医学基 因组学国家重点实验室，上海 200025) [摘要] 目的：探索急性早幼粒细胞 白血病 (acutepromyelocyticleukemia，AI’L)中microRNA、PML— RARa与下游靶基 因组成的调控模式。方法：应用基于染 色质的免疫沉淀 (chromatinimmunoprecipi— tationonchip，ChIP—on-chip)技术并结合数据分析方法对miRNA和PML_RARd与下游靶基 因形成的 调控环路进行研究。结果：在 PML广RARa所调节 的基 因中，相 当一部分 同时也在转录后被 PML_ RARd潜在调节的miRNAs所调节，从而组成特定的调控环路 。对于不同的内含子miRNAs，类型 I的 调控环路模式在 白血病细胞分化过程 中更为普遍存在。结论 ：APL中microRNA 与 PML-RARd通过 特定的调控环路调控下游靶基因的表达。 [关键词]CHIP—on—chip；miRNA；调控网络 [中图分类号]R733．71；Q344．13 [文献标识码]A [文章编号]1007—1237(2012)09—1157—05 Analysisofregulatorynetworksinvolvingm icroRNAsand PML—RAR(xinAPLbasedonhigh- throughputdata IU XU—hui，WANG Kan—kan，ZHANGJi (RuijinHospitalAffilliatedtoMedicalCollegeofShanghaiJiaotongUniversity；StateKeyLabo- ratoryforMedicalGenomic，ShanghaiInstituteofHematology，Shanghai200025，China) [FoundationProject]：Itiss“p9， byNationalNaturalScientificFund(30~ )andS~,pportingProjectofScience and TechnologyCommitteeinShanghai(07SP07C02)． [Author]：T己，Xu—hui(1982一)，Male，NanchangJiangxi，M_M．，TelE-mail： xue947599@126．coTn． Received：2012—05—02 Revised：2012—06—08 JHMC，2012；18(9)：1157—1161 VJew from specialist：Itiscreative，andofcertain scientificandeducationalvalue． [ABSTRACT]Objective：ToinvestigateregulatorymodelinvolvingmieroRNA。PML-RARaand downstream genesin acutepromyelocyticleukemia (APL)．Methods：W ith technologyofCHIP—on-chip anddataanalysis，regulatorynetwork betweenmiRNAsandPML—RARawasanalyzed．Results：Itwas foundthatmostofgenesregulatedbyPML-RARawasregulatedbypotentialtargetedmiRNAsofPML— RAR ；meanwhiletheycomposedaspecificregula