生化蛋白质结工构与功能.ppt

蛋白质的结构和功能 主要参考书 生物化学 第三版 王镜岩 朱圣庚 许长法 主编 高等教育出版社 生物化学 第五版 周爱儒 主编 人民卫生出版社 一、概念 二、组成 化学组成 组成氨基酸 三、结构 共价结构 空间结构 四、功能 五、蛋白质结构与功能的关系 六、蛋白质的理化性质 七、研究基因功能的方法 Protein 这个词来自希腊文Proteios，英文含义是Primary，就是首要的、主要的、初级的意思，可见蛋白质的重要性。 什么是蛋白质? 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。 蛋白质的生物学重要性 1. 蛋白质是生物体重要组成成分 分布广：所有器官、组织都含有蛋白质；细胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高：蛋白质是细胞内最丰富的有机分子，占人体干重的45％，某些组织含量更高，例如脾、肺及横纹肌等高达80％。 碳（C） 50％ 氢（H） 7％ 氧（O） 23％ 氮（N） 16％ 凯氏定氮依据 硫（S） 0～3％ 其他（磷、铁、铜、碘、锌和钼等） （二）氨基酸的分类 各种生物体中发现的氨基酸有180种，组成大多数蛋白质的氨基酸有20种,这20种氨基酸被称为基本氨基酸。 蛋白质中几种重要的稀有氨基酸 在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸，通常称为稀有氨基酸; 这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的; 其中重要的有4-羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、N-甲基赖氨酸、和3,5-二碘酪氨酸等。 非蛋白氨基酸 广泛存在于各种细胞和组织中，呈游离或结合态，但并不组成蛋白质，大部分也是蛋白质氨基酸的衍生物。 H2N-CH2-CH2-COOH H2N-CH2-CH2-CH2-COOH 2、从营养学角度分 必需氨基酸 人体内不能合成，必需从食物中获得的一类氨基酸，共有8种: Leu、Ile、Met、Val、Trp、Phe、Thr、Lys。 非必需氨基酸 人体内能够合成的一类氨基酸。 3、按R基的化学结构分 （1）脂肪族氨基酸 Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Ser、Thr、 Cys、 Met、Asp、Glu、Asn、Gln、Lys、Arg （2）芳香族氨基酸 Phe、Tyr、Trp （3）杂环类氨基酸 His、Pro （三）氨基酸的理化性质 （7）氨基酸的两性性质和等电点 氨基酸的兼性离子形式 氨基酸在中性pH时，羧基以-COO-，氨基以-NH3+形式存在，这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷，称为兼性离子。 氨基酸的等电点（isoeletric point） 当外液pH为某一pH值时，氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等，净电荷为0，这一pH值即为氨基酸的等电点，简称pI。在等电点时，氨基酸既不向正极也不向负极移动，即氨基酸处于两性离子状态。 （四）氨基酸的化学反应 用途：常用于氨基酸的定性或定量分析；用来鉴定多肽或蛋白质NH2末端氨基酸；用于修饰蛋白质。 Primary Structure Mass Spec Principles 4、信号肽 signal peptide 一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。 蛋白质的一级结构中，一段固定的氨基酸序列可能有某种特定的生理功能，称之为signal peptide(信号肽)，例如蛋白质在C-端若有Lys-Asp-Glu-Leu(KDEL)的序列，则会被回收到内质网去。同一信号肽可以在许多不同的蛋白质分子上重复出现。 信号肽分类 进入各种细胞器的信号肽 线粒体signal 核定位signal 内质网signal 蛋白水解酶的识别位点 PEST site （1）线粒体信号肽 （2）核定位信号（NLS） 蛋白在细胞核和细胞质之间的运输称为入核和出核，它是维持细胞内动态稳定的重要因素。这些细胞成分的进核、出核是蛋白合成、细胞增殖和细胞凋亡的关键步骤。这种运输需要一些其它蛋白因子的辅助并要求这些被运输物质上有一特定的可识别定位序列。入核信号称为核定位信号(NLS)，出核信号称为核输出信号(NES)。 NLS的分类 ①单一型NLS 由4-8个氨基酸残基组成的短肽，富含带正电荷的Lys和Arg，通常含有Pro。含有此类NLS的蛋白有：SV40大Ｔ抗原，MDM2，NF-kB