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下述序列中，在双链状态下属于完全回纹结构的序列是A、AGTCCTGA B、AGTCAGTC C、AGTCGACT D、GACTCTGA E、CTGAGATC 北京医科大学1999年招收攻读硕士研究生入学试题 生物化学 3 三股螺旋DNA 3.1 结构特点： ?一条同型的寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸=寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟相结合 ?第三股链的碱基与Watson-Crick碱基对中的嘌呤形成Hoogsteen配对 ?第三股链与寡嘌呤核苷酸为同向平行 3.1.1一条同型的寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸=寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟相结合 大沟 3.1.2第三股链的碱基与Watson-Crick碱基对中的嘌呤形成Hoogsteen配对 ① 第三股螺旋=寡嘌呤核苷酸 A 、T 与A=T中的A，G、C与G=C中的G ②C必须质子化，以提供与G的N7结合的氢键供体，C与G形成两个氢键 * 第二章 核酸 第三节 DNA的二级结构 (一) 二级结构的概念 空间结构：多核苷酸链内或链间通过氢键折叠而成的构象。 DNA的二级结构是指DNA的双螺旋结构。 双螺旋结构是DNA的两条链围着同一中心轴旋绕而成的空间结构。 DNA的双螺旋模型是由Watson和Crick两位科学家于1953年提出的。 三、DNA的二级结构 (二) 双螺旋结构模型提出的依据 三、DNA的二级结构 1、DNA的X-射线衍射图(Franklin and Wilkins) (1) 衍射斑点呈交叉状分布； (2) 衍射点之间的距离与层次表明有0.34nm和3.4nm的周期性； (3) 图的顶上和底部是最强的衍射斑点，呈带状。 (二) 双螺旋结构模型提出的依据 三、DNA的二级结构 2、DNA的碱基组成分析（Chargaff定则） Chargaff规则的内容 　　Ⅰ. 所有DNA：A=T、G=C，即A+G=T+C 　　Ⅱ. DNA的碱基组成具有种的特异性，即不同种的DNA碱基组成不一样 　　Ⅲ. 对同一生物物种，DNA的碱基组成没有组织和器官的特异性 　　Ⅳ. DNA的碱基组成不随年龄、营养状况及环境的改变而改变 Chargaff规则的意义 该规则为后来建立DNA双螺旋结构模型奠定的基础，并为阐明DNA的生物学功能提供了重要依据。 糖环平面与中轴平行；碱基则伸向螺旋内部，碱基平面与中轴垂直。 由两条反向平行的脱氧多核苷酸链围绕同一中心轴构成右手双螺旋结构。 由糖-磷酸通过3’,5’磷酸二酯键相互连接构成的主链处于螺旋外侧。 (三) 双螺旋结构模型的基本特征 1 主链 5’ 5’ 3’ 3’ 中心轴 (三) 双螺旋结构模型的基本特征 A = T G C ≡ （碱基互补具有极其 重要的生物学意义， 是DNA复制、转录、 反转录的分子基础） 2 碱基配对 (三) 双螺旋结构模型的基本特征 3 螺旋参数 0.34 nm 36° 3.4nm 2nm 10 nt 碱基堆积距离0.34nm。每对脱氧核苷酸残基沿纵轴旋转36°所以每10个碱基对形成一个螺旋，螺距3.4nm。双螺旋直径为2nm。 双螺旋表面形成两种凹槽：较浅的叫小沟，另一条叫大沟。 大沟(2.2 nm)：宽 深 小沟(1.2 nm)：窄 深 4 大沟和小沟 G C A T (四) 维持双螺旋结构稳定性的力 三、DNA的二级结构 互补碱基之间的氢键 碱基堆集力：碱基堆集成非极性的核心区域，相互间产生疏水作用和范德华力 ?? 离子键： 磷酸残基上的负电荷与介质中的阳离子之间形成离子键。带正电荷的蛋白质可与带负电荷的DNA结合。 (五) DNA双螺旋结构的形式 三、DNA的二级结构 螺旋桨扭转（Propeller twist）： 就是一个碱基对中的两个碱基并不处于同一平面中，而是两个碱基平面相对碱基的长轴各自向着相反的方向扭转。如果沿着碱基对的长轴看去，靠近的一个碱基总是顺时针方向扭转。这样形成的角度就是螺旋浆扭角。 螺旋桨扭转（Propeller twist） 螺旋桨扭转（Propeller twist） 螺旋桨扭转（Propeller twist） 1. B-DNA：典型的Watson-Crick双螺旋DNA ?相对湿度92% ? DNA钠盐（较低） (五) DNA双螺旋结构的形式 三、DNA的二级结构 ? 螺旋类型 ? B 适中 螺旋方向 右手 螺旋直径nm 2.37 碱基堆积距离nm? 0.34 碱基夹角 34.6° 每圈碱基数 10.4 螺距nm 3.32 轴心位置 穿过碱基对 碱基倾角 -1° 糖环折叠 C2′内式 糖苷键构象 反式 大沟 很宽、较深 小