基于monte carl发o方法模拟的自回避链的计算方法及并行优化.docx

分类号：TP391 分类号：TP391 单位代码：10422 密级： 学 号：2011110031 ⑧ ∥礞力番 SHANDoNG I小i]ⅣERSITY 博士学位论文 Dissertation for Doctoral Degree (同等学力申请博士学位) 论文题目：基于Monte Carlo方法模拟自回避链的计算 方法及并行优化 CAL叫LAT I ON HETHOD AND PA队LLEL OPT I_I ZAT 1 0N 0F S I_ULAT I NG SELF—AV0 I D I NG CHAI N BAS印0N MONTE CARLO METHOD 作者姓名 李洪 培养 单 位计算机科学与技术学院 专业 名 称 计算机系统结构 合作 导 师 201 5年6月1 5日 万方数据 GALCULATI洲METH∞州D GALCULATI洲METH∞州D PARALLEL OPTI_lZATI洲0F SI_U雌TING SELF—AVOIDING CHAlN BASED 0N_0NTE CARL0 METHOD By L I Hong Supervisor：Prof．GONG Bin For the degree of Doctor of Phi Iosophy Shandong University．Jinan．Shandong．P．R．Chin8 June 2015 万方数据 原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独 原创性声明 本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独 立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不 包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的科研成果。对本文的研 究作出重要贡献的个人和集体，均己在文中以明确方式标明。本声明 的法律责任由本人承担。 论文作者签名：三垄翌、 Et 期： 兰!生：堑 关于学位论文使用授权的声明 本人同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的印刷件和 电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权山东大学可以将本学位论 文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印 或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。 (保密论文在解密后应遵守此规定) 论文作者签名：硅主望!导师签名： 日期： 兰里够：6 1 万方数据 山东大学博士学位论文目 山东大学博士学位论文 目 录 摘要 I ABSTRACT IV 第l章绪论 ．．1 1．1 研究背景 ．．1 1．2 研究现状 3 1．3 主要工作 。5 1．4 文章结构 7 第2章高分子链的Monte Carlo模拟算法 ．．8 2．1 Monte Carlo模拟方法 ．8 2．1．1统计抽样的理论依据 8 2。】．2伪随机数产生 9 2．2 高分子链Monte Carlo模拟理论 ．1 0 2．2．1 高分子链统计力学模型 10 2．2．2 Monte Carlo简单抽样方法 1l 2．2．3 Monte Carlo重要性抽样方法 12 2．2．4 Monte Carlo的动力学方法 14 2．2．5 Monte Carlo抽样的统计误差 1 6 2．3 高分子链的Monte Carlo建模 ．1 7 2．3．1链的生长模型——自回避行走的算法 一17 2．3．2链的运动——键长涨落方法 一19 2．3．3 链吸附与构象参数抽样统计 一21 2．4 小结 22 第3章 自回避链在表面临界吸附的标度算法 ．24 3．1 引言 24 3．2 临界吸附的标度算法 25 3．2．1 基于构象性质估计临界点的计算方法 ．．25 万方数据 山东大学博士学位论文3．2．2基于EKB方法标度临界吸附点的计算方法 山东大学博士学位论文 3．2．2基于EKB方法标度临界吸附点的计算方法 26 3．3 均质链有限尺寸的临界标度方法 28 3．3．1有限尺寸标度临界吸附点的算法 。28 3．3．2插值法补充数据的计算 ．．29 3．3．3拟合曲线Ns=aoN# 30 3．3．4临界吸附温度民和交叉指数≯的计算方法 3l 3．3．5关键指数6的计算方法 一32 3．4 两嵌段链A打Bm有限尺寸的l临界标度方法 ．．34 3．4．1模型与计算方法 。34 3．4．2 A。Bn的临界吸附的标度算法 ．35 3．4．3嵌段链A打Bm与均质链～在临界温度逼近计算方法 ．37 3．4．4嵌段链～B埘吸附受尾端B影响的分析与模拟计算 ．．39 3．4．5 基于构象性质外推法模拟嵌段链A打B肌相变点的计算方法 42 3．4．6形状因子与临界吸附点的模拟计算 ．．44 3．5 小结 46 第4章 自回避链构象统计及算法 ．．48 4．1 引言 48 4．2 平行表面间自由均质链的构象