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第六章 核酸 § 2 核酸的结构 核酸是一种线形多聚核苷酸(polynucleotide), 其基本结构单位是核苷酸(nucleotide)。 二、基本结构单位——核苷酸 3、核苷（nucleoside） 核苷是核糖与碱基(嘌呤碱或嘧啶碱)结合物。 嘌呤核苷是嘌呤的第9位N与核糖或脱氧核糖第1′位碳连接； 嘧啶核苷是嘧啶的的第1位N与核糖或脱氧核糖第1′位碳连接； 4、核苷酸（nucleotide） 三、核酸的一级结构 核酸的一级结构是指单核苷酸之间的连接方式。 DNA、RNA都是由许多核苷酸通过3′、5′磷酸二酯键将前一个核苷酸与后一个核苷酸连接起来，形成无分支的多核苷酸链。 在链的一端的一个戊糖的3′位上OH是游离存在的，另一端的戊糖其5位上连有一个磷酸基团呈单磷酸酯状态，这两个末端分别称为3′末端及5′末端。 DNA一级结构的简写形式 核苷酸顺序又称碱基顺序，是蛋白质与RNA结构的生物语言。 (3) 双螺旋的直径是2nm，沿中心轴，每一个螺旋周期有10个核苷酸对，螺距是3.4nm，碱基对之间的距离为0.34nm。 (4) 两链间的碱基以氢键互相配对。A与T配有两个氢键，G与C配有三个氢键。 （二）、RNA（核糖核酸）的结构 天然RNA是单链线形分子，只有局部区域为双螺旋结构。 RNA分子的基本结构是一条线性的多核苷酸链，由四种核糖核苷酸以3‵，5‵-磷酸二酯键连接而成。 rRNA (Ribosomal RNAs ，核糖体RNA)，占80%以上：与蛋白质构成核糖体，催化肽键的形成 mRNA (Messenger RNAs ，信使RNA) ，占5%：是以DNA为模板合成的，又是合成蛋白质的模板 tRNA (Transfer RNAs ，转运RNA)，占15%：在蛋白质合成中转运氨基酸和识别密码子 1、原核mRNA的一级结构的特点∶ 在5‵末端和3‵末端无特殊结构 原核mRNA一般为多顺反子。 顺反子∶是指mRNA上对应于DNA上一个完整基因的一段核苷酸序列。 在mRNA分子内部，每一个顺反子的编码区是从起始密码(AUG)开始，到终止密码(UAG)为止。各个顺反子的编码区之间、5‘端的第一个顺反子的编码区之前以及3’端的最后一个顺反子编码区之后，都含有一段非编码区。 2、真核mRNA的一级结构的特点∶ 真核的mRNA一般为单顺反子，即一条mRNA链只翻译产生一条多肽链。 其结构模式为∶ 5’-“帽子”-5’非编码区-编码区-3’非编码区-3 ’-多聚腺苷酸（polyA）尾 3 ‵-多聚腺苷酸（polyA）尾 3‵-末端有一段20～250个左右的多聚腺苷酸（poly A），称为“尾”结构。 多聚腺苷酸（poly A)尾是在转录后经poly A聚合酶专一性作用添加上的。 poly A尾巴可以延长mRNA的寿命，从而可以增加蛋白质合成的数量。此外，还有助于mRNA穿过核膜，进入细胞质执行其模板功能 3、RNA的空间结构(以tRNA为例) （1）RNA的二级结构 单链RNA分子自身回折，形成局部双螺旋区，未配对的部分则形成突环，螺旋部分称为“茎”或“臂”，非螺旋部分称为“环”，在螺旋区，A与U配对，G与C配对。这种单链RNA自行盘绕形成局部双螺旋的多“茎”多“环” 相间分布的花形结构就是RNA的二级结构。 tRNA的结构特点： （1）分子量在25kd左右，由70－90个核苷酸组成，沉降系数在4S左右； （2）碱基组成中有较多的稀有碱基； （3）3‵末端都为…CpCpAOH用来接受活化的氨基酸。所以这个末端称接受末端； （4）5‵末端大多为pG…,也有pC…的； （5）tRNA的二级结构都呈三叶草形。双螺旋 区构成了叶柄，突环区好象是三叶草形的三片小叶。 （1）氨基酸臂（amino acid arm）由7对碱基组成，富含鸟嘌呤，末端为CCA，接受活化的氨基酸。 （2）二氢尿嘧啶环(dihydrouridine loop)由8一12个核苷酸组成，具有两个二氢尿嘧啶，故得名。通过由3－4对碱基组成的双螺旋区(也称二氢尿嘧啶臂)与tRNA分子的其余部分相连。 （3）反密码环(anticodon loop)由7个核苷酸组成。环中部为反密码子，由3个碱基组成。次黄嘌呤核苷酸(也称肌苷酸，缩写成I)常出现于反密码子中。反密码环通过由5对碱基组成的双螺旋区(反密码臂)与tRNA的其余部分相连。反密码子可识别信使RNA的密码子。 （4）额外环（extra loop ）由3一18个核苷酸组成。不同的tRNA具有不同大小的额外环，所以是tRNA分类的重要指标。 （5）假尿嘧啶核苷－胸腺嘧啶核糖核苷环(TψC环)由7个核苷酸组成，通过由5对碱基组成的双螺旋区(TψC臂)与tRNA的其余部