人类印迹簇的起源和进化-生物信息学没专业毕业论文.pdf.docxVIP

硕士学位论文明确。既然已经证实印迹簇的长链非编码RNA参与调控基因的印迹表达，那么 硕士学位论文 明确。既然已经证实印迹簇的长链非编码RNA参与调控基因的印迹表达，那么 印迹簇的长链非编码RNA是否也通过与DNA结合形成三链结构来参与调控基因 的表达呢?在先期研究中我们开发了预测长链非编码RNA的DNA结合域和DNA 结合位点的软件LongTarget，本研究搜索人类印迹簇中长链非编码RNA在其他 物种的直系同源序列，并使用LongTarget预测多个哺乳动物的同源长链非编码 RNA是否与印迹簇DNA形成三链结构，进而推测人类印迹簇的起源和进化过程。 方弦 首先，长链非编码RNA长度大于1200bp的外显子，将外显子分成每份1000bp 的连续外显子并构建协方差模型，搜索25个哺乳动物的直系同源序列(human， chimp，macaque，marmoset，tarsier，mouse lemur，tree shrew，mouse，rat， guinea pig，squirrel，rabbit，dog，horse，microbat，COW，sheep，alpaca， shrew，elephant，tenrec，armadillo，wallaby，opossum，and platypus)。 因为长链非编码RNA的序列保守性低而结构性保守性高，故采用基于二级结构 比对的RNA序列搜