社群环境下的短尾猴肠道微生物群落结构及适应进化-生分态学专业毕业论文.docx

社群环境下的短尾猴肠道微生物群落结构及适应进化活对短尾猴肠道微生物群落结构影响的路径是什么?(4)短尾猴肠道微生物对 社群环境下的短尾猴肠道微生物群落结构及适应进化 活对短尾猴肠道微生物群落结构影响的路径是什么?(4)短尾猴肠道微生物对 食物资源的动态变化是如何响应的?主要研究结果如下： 一、发现短尾猴肠道微生物群落组成具有高度的植食性适应：主要表现为： (1)在门水平上，以分解利用植物的门类为优势种群。短尾猴的肠道微生物的 优势门为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)，两者占总肠道 微生物的比例高达78％以上。已有大量的研究结果显示：肠道中的厚壁菌门和 拟杆菌门有利于动物消化利用来源于植物的食物资源。(2)在科水平上，短尾猴 的肠道微生物也表现出了对植食性的高度适应。短尾猴肠道微生物占优势的科为 胃瘤菌科(Ruminococcaceae)，普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)和琥珀酸弧 菌科(Succiniv．brionaceae)。这些优势科在其它植食性哺乳动物的肠道中也表 现出了较高的相对丰富度，有利于寄主分解利用来源于植物的复杂食物资源。(3) 在属水平上，短尾猴肠道微生物群落组成再一次表明其对植食性的高度适应。短 尾猴肠道中的优势属为普氏菌属(Prevotella)和琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)。 已有研究显示，具有胃瘤动物的肠道中琥珀酸弧菌属的物种表现出较高的相对丰 富度，他们在可以通过分解代谢来自于植物纤维素中的多糖，帮助寄主生产乙酸 和琥珀酸等营养物质、协助寄主代谢长链脂肪酸；而普氏菌属中的物种在分解利 用来源于水果、谷类和嫩叶中的半纤维素、果胶、淀粉、碳水化合物和单糖具有 重要作用。因此普氏菌属和琥珀酸菌属在短尾猴肠道中的大量分布表明：肠道微 生物对短尾猴高效利用包括树叶、树根、树皮、植物果实、种子等食物具有重要 作用。 二、发现社群结构对短尾猴肠道微生物群落结构的影响较小。(1)短尾猴 的肠道微生物组成和结构在性别间差异不显著。在门类水平上，不同性别间并未 检测出显著的差异，在属类水平上，虽然检测出少量属在性别间存在显著不同， 但这些属相对丰富度较低。除此之外，短尾猴性别间的Alpha多样性和Beta多 样性也未产生显著的分化。(2)短尾猴的肠道微生物组成和结构在年龄组间差 异不显著。在短尾猴的群体中，不同年龄组个体间的拟杆菌门和厚壁菌门并未表 现出显著的差异，这与以往的研究有所不同。除此之外，也未在不同年龄组间产 生差异。这些结果都表明，与年龄相关的肠道微生物菌群除了受到消化生理的影 II 万方数据 摘要响外，可能还受到其他未知因素影响。(3)亲缘关系系数并未对短尾猴肠道微生 摘要 响外，可能还受到其他未知因素影响。(3)亲缘关系系数并未对短尾猴肠道微生 物群落结构产生显著影响。在一些哺乳动物，不同物种间肠道的系统发育与物种 的系统发育高度一致。然而，对于群体生活中的短尾猴个体，不同亲缘关系间并 未表现出显著的不同，这与早期在冈贝国家公园黑猩猩群体内的研究结果一致。 我们推测，群内个体间微生物的水平传播可能影响了亲缘关系个体间和非亲缘关 系个体间肠道微生物群落的变异。 三、“粪便-口腔-肠道是影响短尾猴肠道微生物在群体内传播的潜在重要路 径。(1)野生短尾猴的口腔和肠道微生物群落的Alpha多样性和Beta多样性均 显著不同。该结果表明短尾猴口腔和肠道内含有两种不同类型的微生态系统；而 且，短尾猴不同个体间口腔微生物群落的相似性显著高于不同个体间肠道微生物 群落的相似性，暗示微生物栖息地的开放程度影响不同个体间特定栖息地微生物 群落的相似性。(2)短尾猴口腔微生物群落与肠道微生物群落仍存在着紧密联 系。短尾猴的口腔和肠道核心微生物共享普氏菌属(Prevotella)、密螺旋体属 (Treponema)和拟普雷沃菌属(AIIoprevotella)，表明这三个属都可以在肠道 和口腔微生态系统中建立自己稳定的种群，因此，短尾猴口腔中的这三种微生物 类群对其在肠道中建立种群并长期维持可能具有重要的作用。另外，口腔和肠道 共享的OTUs有413个，这些OTUs所对应的属占了肠道核心微生物的比例高 达89％，该结果很好的支持了“粪便．口腔．肠道”传播路径假说。伴随着寄主进食 行为的发生，这些存在于口腔中的肠道核心微生物极有可能迁移至肠道微生态系 统，对肠道核心微生物的补充具有重要意义。 四、短尾猴肠道微生物群落结构与功能对食物资源的动态变化具有积极响 应。(1)短尾猴肠道微生物组成和结构对食物资源的季节波动具有明显的响应。 短尾猴的肠道微生物多样性(Alpha多样性和Beta多样性)在春季和冬季存在 显著差异。冬季样本中琥珀酸弧菌属(Succinivibri