蛋白质结直构与功能2.ppt

（一）同源蛋白质的物种差异与生物进化 1.同源蛋白质（homologous protein) 在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋 白质。同源蛋白质的氨基酸顺序具有明显的相 似性即为序列同源。 2. 细胞色素c（cytochrome c） 细胞色素c是一种含血红素的电子转运蛋白， 存在于真核生物线粒体中。大多数种属的细胞色 素c，分子量为12，500，含有100个左右的残基。 60个种属的细胞色素c氨基酸顺序以被测定。肽 链中28个位置的氨基酸对所有已测试的种属都相 同的，表明，这些残基是规定细胞色素c功能所 必需的。 3. 系统树 （二）同源蛋白质具有共同的进化起源 例： 氧合血红素蛋白 （三）一级结构的局部断裂和蛋白质激活 1. 血液凝固的生化机制 血液中包含着对立的两个系统：凝血系统 和溶血系统。这两个系统的相互制约既保证血 液在血管中的畅通无阻，又保证血管破裂能及 时堵上。凝血系统包括13个凝血因子，这些因 子以前体形式存在。动物受伤而流血时，这些 前体将在其他因子的作用下被激活，使血液迅 速凝固而将伤口封闭。 凝血过程的主要环节 （1）血浆中的凝血酶原受到血浆和血小板中的一些因子的激活而形成凝血酶； （2）血浆中纤维蛋白原在凝血酶的激活下变为不溶性纤维蛋白网状结构，而使血液变成凝固。 凝血酶原：是一种糖蛋白，分子量为66000，含有 582个氨基酸残基。在凝血酶原致活物的催化下，凝血 酶原分子中的二肽键发生断裂，释放出分子量为32000 的氨基末端片断，形成有活性的凝血酶。 断裂位点：Arg-Gly 2.胰岛素的激活 胰岛素是胰岛的β细胞内质网的核糖体上合 成的。 最初是比胰岛素分子大一倍的单链多肽，称 胰岛素原。胰岛素原可以看成是由一条连接肽， 简称C肽的一端通过两个碱性氨基酸残基与胰岛 素A链的N末端相连。另一端通过另外两个碱性氨 基酸残基与B链的N末端相连。 （四）氨基酸序列决定蛋白质的三维结构 1. 蛋白质的变性 天然蛋白质分子受到某些物理因素如：热、 紫外线、高压和表面张力或化学因素的作用 时，生物活性丧失，溶解度降低，不对称性增 高以及其他的物理化学因素发生改变，这种过 程称为变性作用。 变性的核糖核酸酶的复性是蛋白质的一级结构决定 高级结构的最好例证之一。 六十年代White和Anfinsen进行牛胰核糖核酸酶复 性的经典试验。当天然的RNase在8mol/L尿素存在下用 β-巯基乙醇处理后，分子内的四个二硫键破裂，整个 肽链伸展而成无规则卷曲状，同时活性完全丧失。但 是，当用透析方法将尿素和巯基乙醇除去后，RNase活 性又逐渐恢复，最后达到原来活性的95?100%。 核糖核酸酶变性后再复性的实验证明蛋白 质的一级结构本身是其高级结构形成的基础和 决定性因素，只要环境适宜，它自然会形成其 特定的空间结构，即具有正常功能的天然大分 子构象。 三维结构是多肽链上的各个单键旋转自由 度受到各种限制的总结果。 核糖核酸酶复性后的产物与天然的RNase并无区别， 所有正确配对的二硫键都获得重建。如果在随即重组的 情况下，8个SH基形成4个正确配对的二硫键的概率是 1/105。事实上，当还原后的RNase在8mol/L尿素中被重 新氧化时，只恢复原来天然酶活性的1%左右。这说明 RNase肽链上的一维信息控制肽链自身折叠成特定的天然 构象，并由此决定了Cys残基两两相互接近的正确位置。 由此看来，二硫键对肽链的正确折叠并不是必要的，但 它对稳定折叠态结构作出贡献。 蛋白质的三维结构归根结底是由一级结构序列决定 的。 角蛋白分子中的二硫键 卷发(烫发)的生物化学基础 永久性卷发(烫发)是一项生物化学工程(biochemical engineering),?-角蛋白在湿热条件下可以伸展转变为?-构象，但在冷却干燥时又可自发地恢复原状。 这是因为?-角蛋白的侧链R基一般都比较大，不适于处在?-构象状态，此外?-角蛋白中的螺旋多肽链间有着很多的二硫键交联，这些交联键也是当外力解除后使肽链恢复原状(?-螺旋构象)的重要力量。这就是卷发行业的生化基础。 胶原蛋白的结构 血红蛋白与氧气结合前后F螺旋的构象变化 T 态 = 与氧气结合的亲和力低 R 态 = 与氧气结合的亲和力高 T 态 R 态 解释Hb协同效应的两种模型 (1) 序变模型 (KNF) (2) 齐变模型（MWC） 序变模型 齐变模型 波尔效应 H+和CO2对Hb的氧合的影响是降低Hb与氧气亲和力，即H+和CO2促进Hb释放O2，这样的效应被称为波尔效应。产生波尔效应的原因是H+和CO2能够