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生物化学核酸和蛋白质的生宿物合成
核酸和蛋白质的生物合成 复旦大学药学院 丁廷波 遗传信息传递的规律—中心法则 DNA的生物合成 — 半保留复制 半保留复制的概念 DNA的复制是将两条亲本链分开,每一条作为合成新链的模板,按碱基配对的规则合成新链,形成两个子代DNA双螺旋结构。 子代DNA的双链中一条是原来的链,另一条是新合成的链,称为半保留复制(Semi-conservative replication)。 DNA复制过程(以原核细胞为例) 1.复制的起始 1)复制起始点 2)DnaA蛋白的结合 3)Dna B(解链酶,helicase)的作用 4)单链结合蛋白(SSB)的作用 5)Dna G(引物酶,primase)的作用 6)拓扑异构酶(topoisomerase)的作用 拓扑异构酶有两种。可以切断超螺旋的一条链或者两条链,使超螺旋放松。 2.复制的延伸 DNA聚合酶(DNA polymerase) DNA聚合酶III接在RNA引物后开始合成新DNA链; DNA聚合酶III以二聚体形式存在,分别负责先导链和后滞链上DNA新链的合成; 合成过程中,拓扑异构酶和解旋酶(Dna B)负责解开双链,引物酶负责合成岗崎片段上的引物; 3.复制的终止 E.coli DNA上存在复制终点,Tus(terminus utilization substance)蛋白可以和复制终点结合,阻止复制叉的前进,使复制停止; 新形成的两个子代DNA分子由拓扑异构酶I或II帮助完成分离,形成两个独立的子代DNA分子。 真核生物DNA复制的特点 1.DNA的合成发生在细胞周期的S期。 2.DNA聚合酶有α,β,γ,δ,ε五种。 3.DNA聚合酶α和δ形成复制聚合体, 聚合酶δ合成主导链,聚合酶α合成随从链。 4.聚合酶γ负责线粒体DNA的合成,而ε 和β参与DNA修复。 5.线性DNA的端粒由端粒酶负责复制。 6.多个复制起始点,双向复制。 真核细胞的周期 Gap 1 Synthesis Gap 2 Mitosis DNA的修复 光复活修复(直接修复方式之一) 紫外线下胸腺嘧啶形成二聚体;光复活酶在蓝光照射下活化,解开 二聚体胸腺嘧啶 切除修复 无碱基部位的修复 甲基化指导的不配对修复 RNA的生物合成 — 转录及转录后加工 转录的过程—起始阶段 转录起始阶段RNA聚合酶的作用 转录模板的特点: 1)DNA的一条链为模板 2)不对称转录 原核生物启动子 真核生物的启动子 原核生物的终止子结构 原核生物的RNA聚合酶 真核生物的RNA聚合酶 ρ因子 ρ因子是原核生物中与转录终止有关的蛋白质,具有两种酶活性:解旋酶、ATP酶。 原核生物转录后加工 原核生物的转录和翻译是偶联的,mRNA很少被加工。 原核生物的tRNA和rRNA需要加工。 真核生物转录后加工 1. 5’-端戴帽 2. 3’-端加尾 3.切除内含子,拼接外显子—剪接 4.部分序列的甲基化。 5’-端戴帽 3’-端加尾 RNA剪接示意图 部分序列的甲基化 RNA的另一种合成方式—复制 RNA指导的RNA聚合酶 正链RNA 负链RNA 基因转录的调节 原核细胞转录水平的调节—操纵子学说 操纵子的结构 乳糖操纵子的工作原理 真核细胞基因转录的调节 相关概念: 1.顺式作用元件(顺式调控元件) (Cis-acting element) 2.反式作用因子 (Trans-acting factor) 顺式作用元件(顺式调控元件)(Cis-acting element) 与被调控基因存在于同一个DNA上,能够调节该基因转录的特定序列, 称为顺式作用元件。包括启动子和增强子。 反式作用因子(trans-acting factor) 能直接或间接辨认、结合顺式作用元件的蛋白质,在真核生物有很多种类,统称为反式作用因子。 因子和因子之间又需要互相 辨认、结合,以准确的控制基因是否转录、何时转录。 反式作用因子家族之 — 亮氨酸拉链 反式作用因子家族之 — 锌指结构 DNA的合成方式之— 逆转录 逆转录的过程 1.RNA指导的DNA合成 逆转录酶 2.RNA的水解 RNase H 3.DNA指导的DNA合成 DNA聚合酶 蛋白质的生物合成之— 翻译 mRNA作为翻译的模版 密码子:在mRNA的特定区域(翻译编码区),每三个相邻的碱基组成一个密码子。 同一段mRNA,不同的阅读框架 tRNA转运翻译的原料—氨基酸 tRNA和氨基酸的连接—酯键 密码子与反密码子的摆动配对 rRNA参与构建翻译的工厂—核糖体 翻译过程之—氨基酸的活化 AA + tRNA → 氨基酰-tRNA 细胞中一般只有二十种氨基酰-tRNA合成酶,不同tRNA与同一氨基酸的结合均由同一个酶催化。合成酶有很强的校对功能。 起始氨基酰-tRNA 原核生物的起始氨
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