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第五章先蛋白质化学
第五章 蛋白质;蛋白质是生命活动的物质基础
生物体内的蛋白质是除水以外,机体组织中最多的组分,占人体干重的45%,占细菌干重的50~70% 。;是一切生物体中普遍存在的生物大分子,是生物功能的主要载体。生物遗传形状(存在于信息大分子DNA中)是通过蛋白质来表现的。
酶、调节蛋白、转运蛋白、贮存蛋白等
蛋白质种类繁多、各具一定的相对分子量(一般在一万到一百万,甚至高达数百万)、复杂的分子结构和特定的生物功能。;二、蛋白质的生物学功能;5.参与机体的防御: 机体抵抗外来侵害的防御机能,靠抗体,抗体也称免疫球蛋白,是蛋白质。;三、蛋白质的分类;四. 蛋白质的水解;1.酸水解;2. 碱水解;一. 蛋白质的元素组成;二、蛋白质分子的基本组成单位——氨基酸;蛋白质氨基酸: 蛋白质中常见的20种氨基酸
稀有的蛋白质氨基酸:蛋白质组成中,除上述20种常见氨基酸外,从少数蛋白质中还分离出一些稀有氨基酸,它们都是相应常见氨基酸的衍生物。如4-羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等。
非蛋白质氨基酸:生物体内呈游离或结合态的氨基酸。;二十种常见蛋白质氨基酸的分类、结构及三字符号;1、按氨基酸分子中羧基与氨基的数目分: ;酸性氨基酸及酰胺;碱性氨基酸;2、按侧基R基的结构特点分: ;杂环氨基酸;芳香族氨基酸;甘氨酸 (Gly,G);3、按侧基R基与水的关系分: ;4、按氨基酸是否能在人体内合成分: ;二十种氨基酸的名称和结构如图所示:;注:二十种氨基酸的结构特点
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸
含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸
含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、
甲硫氨酸(含硫甲基)
含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸
含胍基的氨基酸:精氨酸
含咪唑基的氨基酸:组氨酸
亚氨基酸:脯氨酸
含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺
含吲哚基的氨基酸:色氨酸
含ε-氨基的氨基酸:赖氨酸;(三)蛋白质中不常见的氨基酸;(四)非蛋白氨基酸 ;三.氨基酸的理化性质;(二)化学性质; 从上图可知:氨基酸在酸性环境中,主要以阳离子的形式存在,在碱性环境中,主要以阴离子的形式存在。在某一pH环境下,以两性离子(兼性离子)的形式存在。该pH称为该氨基酸的等电点。所以氨基酸的等电点可以定义为:氨基酸所带正负电荷相等时的溶液pH。;2.由α-氨基参加的反应: ;(2)桑格反应
与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应;(3)埃德曼反应
与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应;Edman (苯异硫氰酸酯法)氨基酸顺序分析法实际上也是一种N-端分析法。此法的特点是能够不断重复循环,将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。; 3.α-氨基与α-羧基共同参加的反应
(1)与茚三酮的反应:除脯氨酸与羟脯氨酸外,可与其它氨基酸生成蓝紫色化合物。脯氨酸与羟脯氨酸为黄色化合物。 ; (2)成肽反应:;§3 蛋白质的结构;一、蛋白质的一级结构 ;肽键和肽的结构;2. 氨基酸借肽键连接起来叫肽,肽是一大类物质,即: ;(二)天然活性肽;2.促甲状腺素释放激素:三肽(焦谷氨酰组氨酰脯氨酸),可促进甲状腺素的释放。 ;5.牛催产素与加压素:均为九肽,分子中含有一对二硫键,两者结构类似。前者第九位为Gly或Lys或Phe,后者为Arg。前者可刺激子宫的收缩,促进分娩。后者可促进小动脉收缩,使血压升高,也有抗利尿作用,参与水、盐代谢的调节。 ;(三)蛋白质的一级结构研究 ;3.肽链的拆分:经末端的分析,若该蛋白质含有两条以上的肽链,而且肽链之间是通过非共价键连接,使用蛋白质变性剂将其变性后分开;若蛋白质肽链之间通过共价键相连,则可采取过甲酸氧化法或巯基乙醇还原法将其分开。
4.各肽链中氨基酸排列顺序的测定:使用两种以上的方法将肽链部分水解成肽段,测各肽段的氨基酸顺序,然后使用片段重叠法推测出完整肽链的氨基酸顺序。
5.确定二硫键和酰胺的位置 ;二、蛋白质的二级结构 ;维持蛋白质二级结构的作用力主要是氢键。;(1) α-螺旋结构(α-Helix )
(2) β-折叠结构(β-sheet )
(3) β-转角(β - turn )
(4) 无规卷曲 (random coil);(1)α-螺旋结构特点∶
1) 主链绕中心轴按右手螺旋方向盘旋,侧链伸向螺旋外侧。每3.6 个氨基酸残基前进一圈,每圈前进距离是0.54nm(螺距),每个氨基酸残基占0.15nm。
2) 每个氨基酸残基的亚氨基与它前面第四个氨基酸残基的羰基氧原子形成氢键,氢键与螺旋轴近似平行。; α-螺旋在许多蛋白中存在,如α-角蛋白、血红蛋白、肌红蛋白等,主要由α-螺旋结构组成。;(2)、β-折叠结构(β-片层结构)∶; β-折叠(β-pleated sheets)又称β-片层、β-结
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