分子生前物学第三章dna结构.ppt

Chapter 3 DNA’s structure Antiparallel反向平行 strands of the double helix are organized in opposite orientation, so that the 5′ end of one strand is aligned with the 3′ end of the other strand.Base pairing 碱基配对describes the specific (complementary) interactions of adenine腺嘌呤with thymine胸腺嘧啶or of cytosine胞嘧啶with guanine鸟嘌呤 in a DNA double helix (the former is replaced by adenine with uracil尿嘧啶in double helical RNA).Complementary 互补base pairs碱基对are defined by the pairing reactions in double helical nucleic acids (A with T in DNA or with U in RNA, and C with G).Supercoiling超螺旋describes the coiling of a closed duplex DNA in space so that it crosses over its own axis. 3.1 DNA 的一级结构 定义：核苷酸排列顺序，或称碱基排列顺序。 5’-ATCGGCTAAGGCTCCGACGA--3’ 3’-TAGCCGATTCCGA GGCTGCT--5’ 人类基因组计划――20 世纪生物学最宏伟计划：人类基因组的作图与测序。人类基因组计划（1990-2005）；计划耗资30 亿美元。人类基因组有30 亿碱基对的测序。 A polynucleotide多(聚)核苷酸　chain consists of a series of 5￠-3￠ sugar异戊糖（环形五碳糖） -phosphate磷酸脂基links that form a backbone from which the bases protrude 核苷 nucleotide 核苷酸nucleotide 核苷酸是核苷的磷酸酯。作为DNA或RNA结构单元的核苷酸分别是5′-磷酸-脱氧核糖核苷和5′-磷酸-核糖核苷。 由脱氧核糖和磷酸构成DNA主链（或骨架），其结构单元（由脱氧核糖和磷酸构成）是彼此相同的。对各种DNA一级结构而言，相互间的差别主要是在于所含的碱基的组成、数量及排列顺序上。因此，在描述DNA的一级结构时，总是以其所含碱基的序列为准，并用碱基的第一个英文字母构成的字符串来表示。 如：5’dACGTCCTATTCGGT……3’ The double helix maintains a constant width because purines嘌呤always face pyrimidines嘧啶in the complementary A-T and G-C base pairs. The sequence in the figure is T-A, C-G, A-T, G-C. DNA的一级结构涉及脱氧核糖核苷酸的种类、数量、排列位置和键连接关系 DNA分子在一级结构层次上是由许多脱氧核苷酸分子连接而成的多聚脱氧核苷酸长链分子，通常将链短者称为脱氧寡核苷酸（deoxyoligonucleotide） 在DNA分子中，脱氧核苷酸之间是通过磷酸二酯键连接起来的。 多数DNA是线型分子，也有少数是环形分子。当线型多聚脱氧核糖核苷酸链的3’端羟基与其5’端的磷酸残基缩合成酯后（即形成磷酸二酯键二连接起来），成为环形的DNA。 快速而精确的测定合分析核酸的一级结构，是核酸研究的一项关键技术。目前应用的2种DNA序列测定技术是Sanger等提出的酶法（Sanger method）合Maxam和Gilbert提出的化学降解法（Maxam－Gilbert method） Sanger双脱氧链终止法 DNA的合成总是从5′端向3′端进行的。DNA的合成需要模板以及相应的引导核酸链。DNA的合成过程中，在合成的DNA链的3′末端，依据碱基配对的原则，通过生成新的3′，5′－磷酸二酯键，使DNA链合成终止，产生短的DNA链。 具体测序工作中，平行进行四组反应，每组反应均使用相同的模板，相同的引物以及四种脱氧核苷酸；并在四组反应中各加入适量的四种之一的双脱氧核苷酸，使其随机地接入DNA链中，使链合成终止，产生相应的四