基因、基因组和基因组学是-ldh.pptVIP

基因定位克隆：利用微卫星和SNP全基因组扫描来搜索与疾病性状紧密相关的位点，从而确定疾病相关基因的位置并进一步获得克隆。 功能基因组学：根据已有基因的功能推测基因组中具有相似结构的基因的功能，通过实验手段验证。有效的方法有定点突变、基因敲除（knock-out）和RNA干扰及过量表达技术等。 * * 2.2.2 原核生物基因组的结构与功能 原核生物基因组通常比较简单，其基因组大小在106bp～107bp之间，所包含的基因数目几百个到数千个之间。 原核生物基因组通常由一条环状的双链DNA分子组成，在细胞中与蛋白质结合成染色体的形式，在细胞内形成一个致密的区域，称为 类核（nucleoid）. 大肠杆菌的类核结构模型 大肠杆菌染色体基因组的结构和功能 大肠杆菌基因组序列中的基因密度非常高，编码区所占的比例较大。大肠杆菌中总共有4288个基因，平均编码长度为 950bp，基因之间的间隔区长度为 118bp，而且这些结构基因没有内含子。 大肠杆菌DNA分子中的重复序列很少，但在大肠杆菌基因组中不同部位可以有称为 转座子 的50kb的重复片段。 转座因子 原核生物转座因子主要有二类： 插入序列 (insertion sequence，IS) 复合型转座子 ( composite transposon, Tn) 只有当 IS 转座到某一基因中使该基因失活或插入位点旁边的染色体发生畸变等效应时才会被发现。 IS：2000bp以内，两端都有正向重复序列（direct repeats，DR）和反向重复序列（inverted repeats，IR），中间1kb左右的编码序列，仅编码和转座有关的转座酶。 Tn ：2000～20000bp之间，两端由一对 IS 元件组成，带有与转座作用有关的基因以及其他基因。 根据转座的的机制和结果，可将转座分为： 复制型转座（replicative transposition） 保守型转座（conservative transposition） 复制型 保守型 大肠杆菌染色体外基因组的结构和功能 质粒（plasmid）：一类染色体外具有自主复制能力的环状双链DNA分子，属染色体外基因组。 大肠杆菌质粒是双链环状结构的 DNA 分子。 可以有共价闭合环状 DNA（covalently closed circular DNA，cccDNA）、缺口的环状 DNA、线性DNA 三种结构状态。 质粒对宿主细胞的生存一般不是必需的，但质粒带有某些特殊的不同于宿主细胞的遗传信息，其存在赋予宿主细胞一些遗传性状。 表2-2 细菌质粒所控制的一些性状 抗性 抗生素抗性 氨基糖甙类、β-内酰胺类、大环内酯类及磺胺类等 重金属抗性 汞离子及有机汞制剂、镍、钴、银、铬、铅、锑及铋等 阳离子抗性 砷酸盐、亚砷酸盐、铬酸盐及硼酸盐等 其它抗性 紫外线，X射线，细菌素，质粒控制的修饰系统等 代谢能力 简单糖类的代谢 乳糖、蔗糖及绵籽糖等 卤化物的代谢 2，4-二氯甲苯 复杂碳化合物的代谢 甲苯、萘、樟脑、苯胺、烟碱及烷烃等 蛋白质代谢 明胶及酪蛋白等 其他代谢 色素生成，产硫化氢，胞外DNA酶等 致病性 侵袭力 菌毛、夹膜、黏附因子及血浆凝固酶等 毒素 大肠杆菌肠毒素、破伤风杆菌神经毒素、炭疽杆菌外毒素及鼠疫菌素等 结合转移 性伞毛的合成，表面排斥，致育性抑制，对信息素的反应和抑制等 质粒能自主复制，是能独立复制的复制子（autonomous replicon）。 严紧控制（stringent control）型质粒：其复制常与宿主的繁殖偶联，拷贝数较少，每个细胞中只有1个到十几个拷贝。 松弛控制（relaxed control）型质粒：其复制与宿主不偶联，每个细胞中有几十到几百个拷贝。 质粒的稳定性与不相容性 质粒的不相容性（incompatibility）：两种不同质粒因利用同一复制和维持机制，在复制和随后向子代细胞分配的过程中会发生竞争，从而不能在同一宿主细胞内稳定存在，其中一种质粒将被丢失。 携带不同复制和维持机制的质粒属于不同的不相容群，它们可以共存于同一细胞中。 影响质粒稳定性的因素： ①宿主细胞分裂时质粒能否均衡地分配到子代细胞。 ②质粒分子自身结构的稳定性。 2.2.3 真核生物基因组的结构与功能 真核生物的遗传物质绝大部分存在于细胞核染色体，少部分存在于线粒体或叶绿体中----细胞核基因组和细胞器基因组。 真核生物染色体基因组特点 人类基因组中仅含有25000～30000个基因，远低于预期。在人类基因组中只有很少一部份（约2-3％）DNA序列用以编码蛋白质和结构RNA。 人类基因组中存在大量基因间隔区序列，主要由重复DNA构成。 在基因内部含大量内含子。 单拷