蛋白质组学与疾病标志物开发.pdfVIP

整合性蛋白质组学的研究策略及应用 （实例分析） ‐‐蛋白质组学方法与疾病标志物开发 吴琳 中国科学院北京基因组研究所 2015‐6‐25 疾病标志物 • 可供客观测定和评价的一个指标，可以反映普通生理过程、 病理过程、或治疗反应的情况。 • 疾病标志物的检查，对于疾病的鉴定、早期诊断、预防、 个体化治疗、及治疗过程中的监控可能起到帮助作用。 • 有用的疾病标志物 – 提供风险评估：特异性、敏感性 – 比现有标志物更好、更快、更早、或更便宜 – 操作性强：样品容易获取，现有技术或易学会的技术 – 有明确的靶标 在不同的层次上寻找疾病的痕迹 DNA 风险评估 mRNA 预后 诊断 蛋白质（细胞） 预后 治疗 蛋白质（体液） 诊断 预后 抗体 疾病标志物（蛋白/抗体）的开发过程 发现 验证 应用  蛋白质组学  免疫学方法  免疫学方法 方法 --ELISAI  质谱方法（？） --质谱 --HC --蛋白质芯片 --芯片  质谱方法 --MRM 标志物的数量减少 检测样本数增加 CASE I Discovery of Colorectal Cancer Biomarker Candidates by  Membrane Proteomic Analysis and Subsequent Verification  using Selected Reaction Monitoring (SRM) and Tissue  Microarray (TMA) Analysis Hideaki Kume et al. Mol Cell Proteomics 2014;13:1471-1484 Outline of the experimental workflow Protein Identification Reference pool Cancer w/o metastasis  Cancer w/ metastasis Polyps (18)