甘薯核心种质构建方法研究.PDFVIP

中国农学通报 2019 中国农学通报 2019,35(2): 14-20 Chinese Agricultural Science Bulletin Chinese Agricultural Science Bulletin 甘薯核心种质构建方法研究 罗忠霞，张雄坚，陈景益，姚祝芳，杨义伶，王章英，黄立飞，邹宏达，房伯平 （广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室，广州510640） 摘 要：国家种质广州甘薯圃是国内唯一室外营养体保存的国家种质资源圃。本研究以其中的1200份 甘薯资源为材料，22 个农艺性状为基础，采用因子分析和变量聚类2 种方式对农艺性状进行降维处理， 两步聚类、快速聚类和分层聚类3 种聚类方法结合5 个地理来源对资源分组，组内随机取样与必选资源 相结合的方式构建核心种质，依照上述方案共构建出含15 个甘薯核心种质的样本库。通过变异系数、 标准差符合率和极差符合率评价15 个构建方案的数量性状的代表性，多样性指数和表形频率方差评价 质量性状的代表性。结果表明，以变量聚类进行降维、两步聚类结合地理来源分组、组内随机取样为甘 薯构建核心种质的最佳方案，采用该方法构建的核心种质样本很好地保留了总资源的遗传多样性。 关键词：甘薯；核心种质；农艺性状；降维方法；聚类方法 中图分类号：S324 文献标志码：A 论文编号：cas MethodofSweetPotatoCoreCollectionConstruction LuoZhongxia,ZhangXiongjian,ChenJingyi,YaoZhufang,YangYiling, WangZhangying,HuangLifei,ZouHongda,FangBoping (CropResearchInstitute,GuangdongAcademyofAgriculturalSciences/ GuangdongProvincialKeyLaboratoryofCropGeneticImprovement,Guangzhou510640) Abstract: The National Germplasm Guangzhou Sweet Potato Nursery Genebank is the only national germplasmnurserywithoutdoorvegetativeconservationinChina.Based on 1200sweetpotatogermplasms,we diddimensionalityreductionon22phenotypictraitsbyfactoranalysisandR-cluster.ThreekindsofQ-cluster methodsincludingTwoStepCluster,K-MeansClusterandHierarchiealClusterwerecombinedwithfive geographicalresourcestogroupgermplasms.Thecorecollectionswereconstructedbycombingrandomly sampledandrequiredgermplasms.Accordingtotheabovescheme,sampledatabasewith 15sweetpotatocore collectionswereconstructed.Therepresentativenessofquantitativetraitsinthe 15constructionschemeswas evaluatedbythecoefficientofvariation,standarddeviationconformityandextremedifferenceconformity.The representativenessofqualitytraitswasevaluat