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水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫.PDF
水曲柳TCP4 转录因子克隆及胁迫
和激素下的表达分析
Cloning,analysing and homologous expression of TCP4
transcription factor under abiotic stress and hormone signal
in Fraxinus mandschurica.
G06 刘春浩朱晨 吴雅鑫祁铱格
报告人刘春浩
2019.1.12
中文摘要
英文摘要
前言
1材料和方法
1.1材料处理
1.2研究方法
1. 2. 1 FmTCP4 基因编码区全长的克隆
1. 2. 2 FmTCP4 基因编码区序列的生物信息分析
1. 2. 3 FmTCP4 基因在逆境胁迫和激素信号下的表达分析
2 结果与分析
2. 1 FmTCP4 基因编码区全长的鉴定
2. 2 FmTCP4 蛋白质一级结构的分析
2. 2. 1 氨基酸序列理化性质分析
2. 2. 2 信号肽的预测和分析
2. 2. 3 跨膜结构的预测及分析
2. 2. 4 亚细胞定位预测
2. 3 FmTCP4 蛋白质三维结构的预测
2. 4 FmTCP4 蛋白氨基酸序列比对及保守结构域的预测
2. 5 FmTCP4 蛋白系统进化树的构建
2. 6 FmTCP4 在非生物胁迫下的表达模式
2. 7 FmTCP4 在激素信号下的表达模式
3 结论与讨论
参考文献
摘要:TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。
为进一步研究TCP转录因子在水曲柳生长发育和非生物胁迫中的作用,对水曲柳FmTCP4
基因进行了克隆和详细的生物信息学分析,并且对其在非生物胁迫和激素信号诱导下
的基因表达作了分析。多序列比对结果表明,FmTCP4与拟南芥中调控发育的AtTCP4基
因以及水稻寒冷调控中起重要作用的TCP家族基因OsPCF5具有较高同源性。系统进化树
表明其与金鱼草和芝麻等同源基因亲缘关系较近。基因表达分析表明,FmTCP4响应了
寒冷、盐、干旱等非生物胁迫以及激素信号,说明其可能参与了植物的生长发育和逆
境胁迫的平衡。
关键词:水曲柳;TCP转录因子;基因克隆;生物信息分析
TCP genes encode a plant-specific transcription factors family, which acted as a key
role in regulating plant growth and development and stress response. In order to further
study the mechanism of TCP transcription factor in regulating the growth and development
and abiotic stress of Ash, we cloned detailed analyzed bioinformatics of the FmTCP4, and
analyzed the gene expression pattern under abiotic stress and hormone signal. Multiple
sequence alignment results showed that they have high homology to Arabidopsis thaliana
gene AtTCP4 and Oryza sativa gene OsPCF5, which participated the plant growth and cold
regulation, respectively. Molecular evolution analysis results showed that the genetic
distance of FmTCP4 gene between Antirrhinum majus and Sesamum indicum species is
relatively close .Gene expression analysis shows, that FmTCP4 was responded under cold,
salt, drought and other abi
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