大型机使用手册学习课件.ppt

三 运行环境设置 使用module命令时的注意事项 如果只使用模块名而没有指定版本，则所有操作都是针对缺省版本 当使用module swap反复切换编译器模块时，会引起segmentation fault问题。当需要对编译器进行反复切换时，建议使用module unload / module load来进行操作 module 命令加载的是系统缺省设置的运行环境变量，用户自己的设置，仍然需要通过设置用户主目录下的.bashrc / .bash_profile / .cshrc等来实现 精选 三 运行环境设置 Module 使用示例 [jliu@log02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/11.1.046 2) mvapich2/2.0b [jliu@log02 ~]$ module swap mvapich2 openmpi [jliu@log02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/11.1.046 2) openmpi/1.6.5 [jliu@log02 ~]$ module load ncl netcdf [jliu@log02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/11.1.046 3) ncl/6.1.2 2) openmpi/1.6.5 4) netcdf/4.3.0 精选 三 运行环境设置 [jliu@log02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/11.1.046 3) ncl/6.1.2 2) openmpi/1.6.5 4) netcdf/4.3.0 [jliu@log02 ~]$ module swap netcdf/4.3.0 netcdf/3.6.3 [jliu@log02 ~]$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/11.1.046 3) ncl/6.1.2 2) openmpi/1.6.5 4) netcdf/3.6.3 精选 三 运行环境设置 Fortran 编译命令 Intel : ifort GNU: gfortran PGI : pgf90/pgf77/pgfortran C 编译命令 Intel : icc GNU: gcc PGI : pgcc C++编译命令 Intel : icpc GNU : g++ PGI : pgCC MPI编译命令 Fortran : mpif90, mpif77 C: mpicc C++ : mpic++, mpicxx 精选 四 作业管理 1）队列设置 队列类型 说明 Regular 最多使用512个核，每个用户最多可同时运行2个任务，同时提交5个任务 Economy 最多使用512个核，每个用户最多可同时运行2个任务，同时提交5个任务 Longtime 最多使用336个核，每个用户最多可同时运行1个任务，同时提交2个任务 精选 四 作业管理 2）墙钟限制 队列类型 墙钟限制 Regular 12小时 Economy 24小时 Longtime 无墙钟限制 精选 五　账户管理规则 1）账号申请 项目负责人填写“计算资源申请表”申请资源 项目成员填写“高性能计算机账号申请表”开通其个人账号。 项目负责人指定各成员可以使用的记账账号，开通/停止项目成员账号由项目负责人(或相关授权人员)提出 每个人拥有独立的大型机用户账号 只有有效的项目号和在该项目号下有效的成员才能提交作业 精选 五　账户管理规则 超级计算机计算资源申请表 姓名 院系 电话 电子邮件 计算项目类别 □个人项目 □业务项目 □部门项目 计算项目号 计算项目描述 起止时间 年度配额 （万核·小时） 配额估算依据 申请人： 填表人： 日期： 填表说明： 个人的计算项目号格式为 P+工号+三位数字（第一个为001， 第二个为002，... ）。 业务/部门项目的姓名为实际运行的业务或部门名称，计算项目号由超算中心统一安排，起止时间不用填写。 项目描述要注明实际的科研项目及所用到的的模式或软件。 年度配额仅为预申请配额，最终核准的配额要根据计算机的实际年度计算能力协调分配。 精选 五　账户管理规则 超级计算机账号申请表 姓名 学号