Miseq测序分析围垦后海三棱草湿地土壤微生物群落多样性的季节变化.PDFVIP

文章编号：１６７４５５６６（２０１８）０５０７１８１０ ＤＯＩ：１０．１２０２４／ｊｓｏｕ．２０１８０２０２２２６ Ｍｉｓｅｑ测序分析围垦后海三棱草湿地土壤微生物群落多样性的季 节变化 １ １ １，２ １，２ １，２ １，２ 赵　萌 ，印春生 ，厉成伟 ，钟胜财 ，于克锋 ，方淑波 （１．上海海洋大学 海洋生态与环境学院，上海　２０１３０６；２．上海海洋大学 上海高校水域环境生态工程研究中心，上海 　２０１３０６） 摘　要：为探讨上海南汇东滩湿地围垦后海三棱草土壤微生物群落多样性的季节变化，应用Ｍｉｓｅｑ高通量 测序技术，分析草密集区与光滩区４个季度土壤微生物群落多样性以及相关的土壤环境因子。结果表明， 草密集区与光滩区土壤微生物群落多样性及丰富度差异显著（Ｐ＜０．００１），草密集区高于光滩区，同一区 域样本微生物多样性及丰富度季节变化显著（Ｐ＜０．００１），春夏２季低于秋冬２季。Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ（变形菌 门）、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ（拟杆菌门）、Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ（酸杆菌门）、Ｃｈｌｏｒｏｆｌｅｘｉ（绿弯菌门）、Ｐｌａｎｃｔｏｍｙｃｅｔｅｓ（浮霉菌门）、 Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ（放线菌门）、Ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉａ（蓝藻菌门）是各样本中相对丰度较高的菌门，且样品优势菌季节性差 异较大。ＲＤＡ冗余分析表明，土壤盐分、干湿比、硝态氮是影响土壤微生物群落结构的主要因素。研究对弄 清海三棱草湿地的空间扩张微观机制及促进海三棱草湿地快速修复具有理论意义。 关键词：高通量测序；微生物多样性；海三棱草；沉积环境；湿地修复 中图分类号：Ｘ１７２　　　文献标志码：Ａ 　　海三棱草（Ｓｃｉｒｐｕｓｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ）是长三角区 土壤中一切生物化学反应，在有机质分解与养分 域一种重要的本土湿地植物，广泛分布于上海东 循环等过程中发挥着关键作用。在某一特定地 南部海滨和崇明、长兴、横沙等几大岛屿的中潮 理区域内，生活在同一环境下的不同微生物种群 ［１］ ［７］ 滩，是长江口滨岸带主要的植物群落类型 。海 在组成、结构、功能方面均表现出较大的差异 。 三棱草具有耐盐、耐厌氧环境的特点，是长三 另外，国内外研究认为季节变化对土壤微生物群 ［２］ 角滨海区域重要的先锋植物群落 。２１世纪以 落结构和多样性有显著影响，而微生物生物量的 来，上海市加大了围垦工程力度，围垦改变了生 季节波动受植被生长和土壤有机质的影响［８１０］， 态系统的自然发展模式，加快了海岸线自然环境 海三棱草的生长也随着季节变化，从春天开始 的沉积速度。泥沙淤积使海三棱草球茎处于 萌发，夏季旺盛生长，到秋季开花结果，冬季死亡 深埋状态，而适宜较高高程潮滩的芦苇占据竞争 腐烂，整个生长周期根际土壤环境发生改变，从 优势并形成芦苇群落，挤压海三棱草向低高程 而影响微生物的代谢活性。因此土壤微生物的 潮滩展开［２］，而在低潮滩，海三棱草生态位与 多样性与植物生长有着密切的关系。 外来入侵种互花米草（Ｓｐａｔｉｎａａｌｔｅｒｎｉｆｌｏｒａ）的生态 高通量测序已广泛应用于土壤微生物多样 位发生重叠和竞争排斥，使海三棱草的面积进 性的研究［１１１４］，该测序技术相对于传统的多样性 ［３］ 研究方法，具有测序通量高，实验过程简化，速度 一步加速缩减 。 目前国内外对海三棱草的研究大多在种 快，准确率高等极大的优势，实验结果更能全面 ［４６］