组学技术在燃料乙醇生产用酿酒酵母菌株构建中的应用-生物通.PDFVIP

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１４，３４（２）：１１８１２８ ＤＯＩ：１０．１３５２３／ｊ．ｃｂ “组学”技术在燃料乙醇生产用酿酒 酵母菌株构建中的应用 ２ ２ 李云成　汤岳琴 　木田建次 （１四川大学轻纺与食品学院　成都　６１００６５　２四川大学建筑与环境学院　成都　６１０２０７） 摘要　酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）是工业乙醇生产广泛使用的微生物，构建能同时发酵戊 糖以及具有优良抑制物耐受能力的高产菌株，在燃料乙醇生产技术开发中具有十分重要的地位。 基因组学、蛋白组学、转录组学、代谢组学和流量组学等“组学”技术可从基因型到表现型不同层 次揭示生命活动规律，在燃料乙醇生产用酵母菌株的构建中具有广阔的应用前景，特别是目标基 因的识别、代谢途径的优化、代谢机理的揭示等。运用“组学”技术可使菌株构建工作更具靶向性 和明确性，更加易于获得目标性状，并大大缩短育种周期。综述了“组学”技术在燃料乙醇生产用 酿酒酵母菌株构建中的应用及相关研究进展。 关键词　燃料乙醇　酿酒酵母　菌株构建　组学技术 中图分类号　Ｑ８１５ 　　煤、石油、天然气一直被认为是人类生存和发展的 和木质素组成，其中的纤维素和半纤维素需要水解转 三大支柱能源。随着石油短缺带来的能源危机和化石 化为葡萄糖、木糖等可被微生物利用的单糖后才能被 燃料消耗造成的环境污染越来越严重，清洁可再生能 微生物发酵转化为乙醇。在木质纤维素水解获得的糖 源如风能、太阳能、海洋能以及生物质能成为人们日益 液中，约有２０％～３０％的糖为木糖及少量的其他戊糖， 关注的焦点。生物质能是生物质将太阳能以化学能形 野生型酿酒酵母无法将其利用；另外，水解的过程还不 式加以储存的一类可再生能源。在众多的生物燃料 可避免地会产生如有机酸、糠醛类、酚类等小分子抑制 中，生物乙醇被认为是一种典型的可替代运输燃油的 剂，抑制酵母的生长及发酵。因此，在燃料乙醇生产菌 重要液体燃料。 株选育过程中，构建能同时发酵戊糖，以及具有优良的 　　微生物发酵法是目前燃料乙醇最主要的生产方 抑制剂耐受能力的工程菌株，具有十分重要的意义。 法，生产用菌株是燃料乙醇生产的一个关键制约因素。 　　传统的菌株改造方法主要通过多次随机诱变和定 相对于细菌而言，酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ） 向筛选，或通过驯化获得优良菌株，这些方法存在改造 具备优良的产乙醇能力，对环境因素具有较好耐受力， 过程随机性大，费时费力，并且对性能提高的机制认识 适合于工业粗放控制工艺，因此是目前淀粉及糖质原 ［４５］ 不足等问题 。由于生物体的复杂性，一个或多个基 料的工业化乙醇生产主要使用的微生物。然而，糖质 因的变化可能会引起细胞的表型改变与预期结果不 或淀粉质的生物质是人类食物及动物饲料的原料，大 同，而“组学”技术（ｏｍｉｃｓｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）的发展，使人们可 ［１３］ 规模将其用于生产燃料乙醇势必会造成粮食危机 。 以在不同层次上更加系统深入地解析这些机制，同时 木质纤维素类生物质被认为是生产燃料乙醇最理想的 挖掘更多具有新功能的基因