葡萄霜霉病毒全基因组测序及候选效应蛋白r7的功能研究植物病理学专业论文.docxVIP

Secrecy： Secrecy： No． Chinese Academy ofAgricultural Sciences Dissertation Whole Crffflomo Sequencing ofPlasmopara viticola and Functional Analysis of RXLR Effector Protein R7 M．S．Candidate：Kong Xiangiiu Supervisor：Professor Wang Zhongyue Major：Plant Pathology Specialty：Epidemic and Monitoring of Plant Disease June 2015 万方数据 独创性声。明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成 独创性声。明 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成 果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其它人已经 发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位 或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文 中作了明确的说明并表示了谢意。 研究生签名：孔祥久 时间： 加侈年石月2日 关于论文使用授权的声明 本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业 科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、 缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式 在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。 研究生签名：孔洋久 时间： 扣侈年6月二13 导师签名： 多嘭沈 时间：砂，J一年衫月2日 万方数据 中国农业科学院 中国农业科学院 硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表 论文题目 葡萄霜霉菌全基因组测序及候选效应蛋白R7的功能研究 植物病害流行 论文作者 孔祥久 专业 植物病理学 研究方向 和监测 指导教师 王忠跃研究员 培养单位(研究所) 植物保护研究所 硕(博) 姓名 职称 单 位 专业 签名 导师 评 王琦 教授 硕导口 中国农业大学 植物病理学 ＼＼ 博导函 阋 人 刘太国 贝 博导口 植物保护研究所 植物病理学 ＼＼ 副研究 硕导团 中国农业科学院 张力群 教授 中国农业大学 植物病理学 删 ：畜 辩 硕导口 教授 中国农业大学 植物病理学 磁 主 博导团 席 k 硕导口 王琦 博导团 ∥ 】 刘伟成 研究员 硕导口 北京市农林科学院 植物病理学 勘Ijl丙蔽 徐世昌 研究员 咿 博导团 ：畜 中国农业科学院植物 ／ 硕导口 植物病理学 博导团 保护研究所 辩 李世访 研究员 中国农业科学院植物 植物病理学 秀硝 硕导口 博导团 保护研究所 委 硕导口 中国农业科学院植物 冯 洁 研究员 博导团 保护研究所 植物病理学 冽毛 员 赵廷昌 研究员 硕导口 中国农业科学院植物 植物病理学 毒木瞻 博导团 保护研究所 会议记录(秘书) 张吴助理研究员 论文答辩时间地点 植保所第二会议室，2015年5月18日8时 万方数据 摘要葡萄霜霉病(Grape 摘要 葡萄霜霉病(Grape Downy Mildew)是全球范围内危害葡萄生产的重大病害，病害流行年 份可造成20％～80％的损失，严重时几乎颗粒无收。成功和高效防控葡萄霜霉病是葡萄产业健康 发展的重要条件。探索葡萄霜霉病菌(Plasmopara viticola)与葡萄的互作关系，可以为葡萄霜 霉病的防控提供更为有效的途径或方法。本研究完成了葡萄霜霉病菌的全基因组测序，对得到 的数据进行了生物信息学分析，预测了含有R．XLR保守结构域的候选效应蛋白，并对候选蛋白 R7(本实验室命名)进行了功能鉴定，为揭示葡萄霜霉病菌的致病机制，研发新的防控技术提 供了分子基础和依据。主要研究结果如下： 1．葡萄霜霉病菌的全基因组测序及数据分析 采用454和illumina方法对葡萄霜霉病菌进行全基因组测序，共建立了4个库，最终获 得10．37 G数据。根据现组装结果确定基因组大小约为240 M，远大于原先估计的120 M， 与致病疫霉大小相似，大于其它已测序的卵菌。对基因组进行nt库同源注释，发现同源性 较高的多为细菌，在卵菌中，与致病疫霉(Hytophthora infestans)同源性最高，而与库中葡 萄霜霉病菌同源序列为1．28％，这也说明nt库中所含的葡萄霜霉病菌基因序列信息非常少。 2．葡萄霜霉病菌RXLR候选效应蛋白的预测 对基因组序列进行生物信息学分析，最终预测出RXLR／QXLR候选效应子序列1822个， 其中含有RXLR／QXLR-dEER结构域的共97个。预测的RXLR效应