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鹅scd1基因的遗传变异及其组织表达规律的研究动物遗传育种与繁殖专业论文
l\愀渊鹅SODl基因的遗传变异及其组织表达规律的研究
l\愀渊
鹅SODl基因的遗传变异及其组织表达规律的研究
研究生:张蕊
导师:龚道清教授 (扬州大学动物科学与技术学院,225009)
摘要
硬脂酰辅酶A去饱和酶(Stearoyl.CoA desaturase,SCD)1是合成单不饱和脂 肪酸的限速酶,它主要催化饱和脂肪酸——硬脂酰辅酶A(C16:0)和棕榈酰辅 酶A(C18:0)在第9和10碳原子间导入氢键,分别形成单不饱和脂肪酸—— 油酸(C16:1)和棕榈酸(C18:1)。本研究以原鸡SCDl基因序列为基础,设 计引物扩增并克隆朗德鹅SCDl基因CDS序列;以扩增得到的朗德鹅SCDl基因
的CDS序列为模板,设计多对覆盖全CDS序列的引物,对朗德鹅、狮头鹅、四 川白鹅和豁眼鹅进行SNP分析;运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,研究SCDl 基因在朗德鹅各组织中的表达状况、对照组和填肥组之间的表达水平差异、不同 填饲阶段的组织表达规律,以及禁食对其表达的影响。主要结果如下:
1、克隆了朗德鹅SCDl基因的完整CDS序列,全长1083bp,包含6个外显 子,编码360个氨基酸。预测其蛋白质分子量为40967.2Da,等电点为8.8,为亲 水性蛋白,存在4个跨膜区域。预测其氨基酸二级结构存在Alpha螺旋、延长片
段和无规卷曲三种结构。与人、小鼠、牛、原鸡和斑胸草雀的同源性为72%.92%。 2、采用PCR.SSCP技术检测SCDl基因的多态性,在狮头鹅、四川白鹅和豁 眼鹅的外显子3上(外显子3的50bp处)均发现了T/C碱基替换,产生了AA、
AB和BB三种基因型,而朗德鹅此位点为野生型AA型,没有发生突变。
3、朗德鹅外显子2上(外显子2的132bp处)发生了T/C碱基替换,导致
产生从、AB和BB三种基因型。三种基因型与产肝性能相关性不显著(尸0.05)。
4、应用荧光定量PCR技术检测了SCDI基因在肝脏等12个组织的表达情况。 SCDl基因在填肥组朗德鹅的肝脏和脂肪中的相对表达量较高达到1.0623和 0.6448。其中,填肥组的肝脏、脂肪中SCDl基因的表达量是对照组的2倍。
5、肝脏、脂肪、下丘脑和胸肌中SCDl基因表达量在填饲10d达到较高水平, 填饲19d后表达有所降低。但总体而言,SCDl基因在填饲组的四个组织中表达
量都增加。在对照组中,禁食24h后,四个组织中SCDl基因的表达量均急剧下降。
量都增加。在对照组中,禁食24h后,四个组织中SCDl基因的表达量均急剧下
降。
关键词:朗德鹅;硬脂酰辅酶A去饱和酶l;PCR.SSCP;填饲;组织表达
The
The Genetic Variation and Tissues Expression Pattern of Goose SCDl Gene
M.S.Candidate:Zhang Rui
Supervisor:Prof.Gong Daoqing
(College ofAnimal Science and Technology,Yangzhou University)
Abstract
Stearoyl—CoA desaturase(SCD)I is the rate—limiting enzyme responsible for synthesis of monounsaturated fatty acids that catalyzes the insertion of the cis double bond at the delta9 position of stearoyl—CoA(C 1 6:0)and palmitoyl-CoA(C 1 8:0), which ore converted into oleic acid(C16:1)and palmitic acid(C1 8:1),respectively. The experiments were designed to clone Landes geese’S CDS sequence of SCDl gene based on the sequence of Gallus.The primers were designed for whole CDS sequence to detect the single nucleotide polymorphism(SNP)in Landes,Lion Head,Sichuan white and Huoyan geese,respectively.The SCD I gene expression in tissues and in different feeding stages and in fasting group,
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