CYP72B1基因和AUR3基因响应光、生长素.PDF

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2009, 36(9): 1215~1221 CYP72B1 因和A UR3 基因响应光、生长素 和油菜素内酯的转录调控机制研究* 1, 4) 1)** 3) 2) 张长青 王 进 朱怀球 高 翔 1) 2) ( 南京大学生命科学学院，医药生物技术国家重点实验室，南京210093； 南京大学模式动物研究所，南京2 10061 ； 3) 4) 北京大学理论生物中心，北京100871； 金陵科技学院园艺学院，南京2 10038) 摘要 为研究光、生长素和油菜素内酯在基因层次上的互作机制，开发了转录调控元件识别工具OCMMat ，其中，在对共表 达基因信息和直系同源基因信息进行整合时，利用了转录调控元件在直系同源基因启动子中的富集性 利用该方 发现， CYP72B1 基因和A UR3 基因启动子含有3 个相同的调控模序GAGACA、AAGAAAAA 、ATCATG ，它们分别承担了AuxRE 元件、GT 元件和GT 辅助元件的功能 其中，ATCATG 模序是目前尚未报道过的调控元件，与AAGAAAAA 模序的距离相 对恒定 基于调控元件识别结果，构建了CYP72B1 基因和A UR3 基因响应光、生长素和油菜素内酯的转录调控模型，模型 显示：光信号和生长素、油菜素内酯信号在CYP72B1 基因和A UR3 基因的转录调控元件上相互交叠，而生长素和油菜素内 酯信号则在转录因子ARF 水平上相交 关键词 CYP72B1 基因，A UR3 基因，转录调控，元件识别，GT 元件，AuxRE 元件 学科分类号 Q756，Q341 DOI: 10.3724/SP.J.1206.2009.00088 植物诸多生长发育过程，如种子萌发、光形态 因启动子中转录调控元件高频特征开发的工具和基 建成、向光性弯曲、开花结果等，均受光、生长素 于直系同源基因启动子中转录调控元件保守特征开 和油菜素内酯调控 利用拟 芥、水稻等模式植 发的工具 这两类方 均有其不足之处，前者往往 物，人们已确立了它们信号转导的基本组分和通 假阳性率比较高，而后者则仅适用于分离时间为 [6] 路 但进一步研究发现，这些通路并不独立，它们 500～700 万年的物种 对植物而言，目前完成全 [1] 在多个环节和步骤上相互交叉和联接 ，表现出不 基因组测序的物种较少，而基因表达谱数据又相对 同层次上的互作(crosstalk) 基于突变体筛选、酵 丰富，因此，还仅局限于前一类方 的广泛应用 母双杂交、蛋白质芯片等技术，人们已鉴定出多个 如何能既降低假阳性率、同时又摆脱对物种分离时 [2, 3] 间上的依赖是开发植物基因转录调控元件识别工具 光、生长素和油菜素内酯的共调控蛋白 ，并揭 示了它们的部分互作机制，但在生物调控最基本的 面临的主要问题 基因层面上，相关工作却进展缓慢，迄今仅停留在 基于转录调控元件的进化保守特征， 们提出 [1] 了转录调控元件在直系同源基因启动子中的富集思 对共表达基因的识别上 ，如何鉴定其中的共调控 [4]