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技术概述 采用 RNA ScreenTape 分析法进行 DV200 评估 作者 摘要 Eva Graf RNA 测序文库制备工作流程的成功与否在很大程度上取决于 RNA 起始材料的质量。 安捷伦科技有限公司 采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法获得的 RNA 完整值当量 (RINe) 是一种评估标 Waldbronn, Germany 准 RNA 测序的样品完整性的可靠且可重现的指标。由于 RNA 降解以及样品体积有 限，从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织中提取 RNA 样品进行文库制备具有挑战 性，因此建议针对 FFPE RNA 文库制备采用定制方案。FFPE RNA 样品的片段大小 分布对文库产率具有重要影响，可以将其描述为大于 200 个核苷酸的 RNA 片段所占 1 的百分比，用 DV200 质量指标来表示 。Agilent RNA ScreenTape 和安捷伦高灵敏度 RNA ScreenTape 分析法有助于对从 FFPE 组织中提取的降解 RNA 样品进行高可重 现的 DV200 评估。Agilent TapeStation 分析软件能够通过区域分析对 DV200 数据进行 简单评估和处理，自动进行重复 DV200 分析。 技术详情 数据分析 数据文件的区域设置 如果要将 DV 2 0 0 区域定义为默认适用 使用配有 Agilent TapeStation 分析软件 DV200 表示大于 200 个核苷酸的 RNA 片 于单个数据文件中所有样品，请单击 （A.02.02 版）的 Agilent 4200 TapeStation 段占所有 RNA 片段的百分比。通过定 Region，然后单击Region Settings，在 系统。RNA ScreenTape （部件号 5067- 义大于 200 个核苷酸的区域，可以利用 对话框中输入区域下限和上限（图 1）。 5576）和试剂（部件号 5067-5577 和 TapeStation 分析软件计算得出 DV200。该 如需在电泳图中识别该区域，请输入 5067-5578），以及安捷伦高灵敏度 RNA 软件提供了区域设置的多种方式，适用于 DV200 作为区域注释。要将该区域应用 ScreenTape （部件号 5067-5579）和试 从低到高的各种样品通量。如需了解更多 于现用文件中的所有样品，请选择 This 剂（部件号 5067-5580 和 5067-5581） 信息以及关于区域分析的演示视频，请咨 File。 均购自安捷伦科技公司。除非另有说明， 询安捷伦信息中心 (AIC)。 否则所有分析均按照生产商的方案和指南 单个样品的区域设置 进行。采用 ScreenTape 分析法对所有样 为单个样品定义 DV 2 0 0 区域，请单击 品进行分析，每个胶条包含梯度分子量内 Re