20180409__第一次联合meeting_-_10410209_应化三蔡旻纭.PPT

電噴霧電離質譜（ electrospray ionization mass spectrometry） 電噴霧電離質譜（簡稱為 ESI-MS） 樣品溶液經很細的進樣管進入電噴霧室，在強電場的作用下，樣品溶液在出口處因電荷的分離和靜電引力而破碎成許多細小的帶有電荷的液滴。 在電場的作用下，帶電液滴逆著乾燥氣體流動的方向，向質譜計入口處漂移，逆向的乾燥氣體使液滴迅速蒸發，並使液滴表面的電荷濃度增大，當庫侖斥力和液滴表面張力極限值相等時，液滴就會爆裂成更小的液滴，直到液滴變得非常小，由於液滴的曲率半徑很小，而它的表面電荷密度很大，結果在液滴表面形成非常強的電場，這電場足以從液滴中解吸出離子。 * 離子經玻璃毛細管進入壓力為幾托的第一真空區，在那裡可以進行碰撞活化裂解，獲得樣品分子的碎片，從而可獲得分子的結構信息。 樣品的分子離子和裂片離子經一系列分離器和靜電透鏡進入質量分析器進行質譜分析。 這種電噴霧質譜法具有很高靈敏度，且電離的分子可以帶有多電荷，這種多電荷離子的產生大大擴展了普通質譜儀能分析的質量範圍，使質譜儀可以分析分子量為幾十萬質量單位的蛋白質分子。 * X-RAY繞射 ( X-ray diffraction ) 利用特性x光入射到結晶材料，在某些入射角材料的相鄰結晶面散射波彼此相位相同，且光程差為波長的整數倍，因此發生建設性干涉。滿足此條件便可產生繞射。 單晶繞射分析可用來測定晶體的方向、對稱性及晶格常數。 * * 含有單核非血紅素鐵中心的金屬酶涉及多種生物學作用，包括用於化合物的氧化。 這些非血紅素鐵加氧酶形成一類利用O2進行催化氧化的酶，並且通常由與鐵中心結合的2-His-1-羧酸鹽供體組組成，像是半胱氨酸雙加氧酶（CDO）。 在本篇的半胱氨酸雙加氧酶（CDO）與其他半胱氨酸雙加氧酶的不同之處在於是由具活性的單核FeII中心和三個組胺酸殘基結合中組成。 CDO在與化合物結合時，會利用O2使半胱氨酸氧化成半胱氨酸亞磺酸（Cys-SO2H）。 ?這種酶對維持體內半胱氨酸的健康水平也是至關重要的。 CDO?用O?2氧化半胱氨酸的機制 作者先用半胱胺酸跟CDO結合後再用O2氧化轉換成半胱胺亞磺酸。 * 這作者之前合成出來的兩個化合物。 * 這是作者之前合成的2個化合物的做法。 只是在CDO 中，三個氮與鐵是屬於面配位的構形， (問題：面配位的構形是啥? 答案：每個氮之間都是夾90度。) 而在黑色的化合物 [Fe(L3NS) (OTf)]中，形成扭曲的四角錐，但這不是作者所希望的構形。 將上面兩個藥品添加三氟鉀磺酸鐵(II)在鹼性條件下反應，並加熱到 80 °C， 經由純化後可生成一黑色的化合物 [Fe(L3NS) (OTf)] 。 上面兩個藥品形成非對稱的 LN3S 配位基能提供三個中性的 (neutral) 氮原子以及一個帶一價負電荷 (mono anionic) 的硫原子用以穩定二價鐵的結構。 此外，這時候化合物 1 的配位環境就如同人體 CDO 的活性中心結構，也是二價鐵為中心。 再加入過量的氧跟CH2Cl2當作溶劑，氧氣會配位在鐵上，使配位基上的硫基磺酸化，形成一棕色化合物，功能上亦與 CDO 相當類似。 而在CDO 中，三個氮與鐵是屬於面配位的構形， (問題：面配位的構形是啥? 答案：每個氮之間都是夾90度。) 在黑色的化合物 [Fe(L3NS) (OTf)]中，三個氮是以一扭曲的平面架構為扭曲的平面四角錐。 * [Fe(L3NS) (OTf)]中，形成扭曲的平面四角錐。(我看不出來哪裡有扭曲的平面四角錐) * 為了改進我們的模型設計，我們準備五牙基N4Py配體，因為他（1）提供三個中性N供體，（2）穩定Fe?II，（3）允許容易地摻入硫醇化物供體，以及（4）包括抗空間保護作用，以獲得生物相關模型。將其中的一個胺基模擬成半胱胺酸接上去的樣子。 (問題：S上的圓弧表示什麼? 答案：省略s上的苯) (問題：什麼是面部排列? 答案：面配位) (問題：提供的三個中性N供體是哪三個? 及第四個N供體以模擬來自Cys的氨基配位是哪個? 答案：) (問題：為什麼要選擇用N4Py? 答案： 因為五牙基N4Py配體具有剛性結構，其以四角錐方式結合FeII，並且它允許表徵和分離幾種關鍵的Fe-O中間體 [例如，Fe = O，Fe-OO（H）]。 五牙基N4Py配體的優點（1）提供三個中性N供體，（2）穩定Fe?II，（3）允許容易地摻入硫醇化物供體，以及（4）包括抗空間保護作用，以獲得生物相關模型。) (剛性指的是有機化合物分子的空間結構不易在外力作用下發生變形。) * 第三丁基醇鉀用於將丙晴脫去 * * 這張是化合物1跟2的單晶X-RAY繞射結構圖。 化合物2的Fe-S鍵長比化合物1短，對應於亞