作物表型组数据库研究进展及展望.PDFVIP

China Agricultural Informatics Vol No Oct 第30 卷第5 期2018 年10 月 2018 ，30 （5 ）：13-23 .30 ， .5 ．，2018 作物表型组数据库研究进展及展望 1，2 1，2 1，2 1，2 王 璐 ，张　颖 ，潘晓迪 ，卢宪菊 ， 璟 马黎明1，2 ，郭新宇1，2 ※ （1. 北京市农林科学院北京农业信息技术研究中心，北京 100097；2. 数字植物北京重点实验室，北京 100097 ） 摘要：【目的】总结归纳作物表型数据库的研究进展，对作物表型数据库的构建进行展望。 【方法】采用文献综述法，从 Web of Science 、NCBI 的 PubMed 和中国知网等常用公共文献 数据库中对已发表的作物表型组学相关研究文献进行检索，据此对国内外作物表型组学研究 现状进行分析，并基于其中的数据库研究，对目前的作物表型相关数据库进行了介绍。最后 对作物表型组数据库构建标准及要求进行了介绍。【结果】不同于基因组学已有许多大型的、 公认的、成熟的公共数据库，有关作物表型组学的数据库虽已有一些，但综合性较强、普适 性较广的通用标准数据库却不是很多。因此，构建综合性作物表型组标准数据库或构建特定 作物的表型组数据库，将成为该领域相关研究人员的工作重点。【结论】农业信息化是现代 农业的一个必然发展趋势，作物表型组数据库的构建也是顺应时代发展的产物。今后，在充 分利用各种综合和专用数据库的基础上，研究人员应在实际研究中构建自己的作物表型组数 据库，增强数据管理和共享。 关键词：作物；表型组；数据库；构建标准；数据管理 DOI ：10.12105/j.issn.1672-0423 0　引言 作物及其相关领域科学研究与粮食问题息息相关。由于全球气候变化，作物生产面 临着更频繁的极端天气，加之有限的水分及养分资源和可耕地面积，农业生产迫切需要 新型气候适应性品种的繁育，以满足人们日益增长的粮食需求以及生物能源等其他工业 用途的作物供应需求。 ［1-2 ］ ［3 ］ 随着人类基因组计划（Human Genome Project ，HGP ）的完成，水稻 、玉米 、 ［4 ］ ［5 ］ ［6 ］ 高粱 、大豆 和小麦 等主要农作物的基因组也相继被破译，作物研究随之进入 　　收稿日期：2018-09-15 　 王 璐（ 1990—），女，汉族，河北邯郸人，硕士、助理工程师。研究方向：生物信息学。 　　第一作者简介： 璟 　　　　　　　　　Email ：wangjl@ 　 郭新宇（ 1973—），男，汉族，内蒙古人，博士、研究员。研究方向：数字植物理论研究。 　　 ※通信作者简介： 　　　　　　　　　　 Email ：guoxy@ 　　* 基金项目：　 国家自然科学基金（No）；北京市自然科学基金青年项目（5174033 ）；北京市农林科学院数 字植物科技创新团队（JKNYT201604 ）；北京市博士后工作经费资助项目（2016 ZZ-66 ）；北京市博士后 科研活动经费资助（2018-ZZ-060 ）；院科技创新能力建设专项—基于组学的玉米维管束形成机理解析 （KJC） ·14 · 王璟璐等：作物表型组数据库研究进展及展望 第30卷