软枣猕猴桃GDP.pdf

ＧＤＰＬ 软枣猕猴桃 半乳糖磷酸酶电子克隆与生物信息学分析 　 　 　 　 　 　 　（ 　 １５００４０） 张开雪 任伟超 闫嵩 刘振鹏 徐姣 刘秀波 马伟 黑龙江中医药大学药学院 哈尔滨 　 　 ： ＧＤＰＬ （ＧＧＰ） 。 ： ＧＧＰ 摘 要 目的 通过电子克隆技术对软枣猕猴桃 半乳糖磷酸酶 基因进行预测 方法 以猕猴桃 序列为探 ， ＮＣＢＩ ＥＳＴ ＣＡＰ３ ， 针 基于 中软枣猕猴桃的 数据库和 在线软件进行序列拼接 利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功 。 ： ＧＧＰ １８６６ｂｐ， １３５３ｂｐ ， ４５０ 。 ： 能进行预测分析 结果 软枣猕猴桃 基因全长 包含 的开放阅读框 编码 个氨基酸 结论 本研究 为进一步解释基因的分子功能奠定理论及实验基础。 　 ；ＧＤＰＬ ； ； 关键词 软枣猕猴桃 半乳糖磷酸酶 电子克隆 生物信息学 中图分类号：Ｑ７５　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００８０４９Ｘ（２０１６）１１２０６６０４ ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＩｎＳｉｌｉｃｏＣｌｏｎｉｎｇａｎｄＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｆｏｒＧＤＰＬｇａｌａｃｔｏｓｅＰｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｓｅｆｒｏｍＡｃｔｉｎｉｄｉａＡｒｇｕｔａ ＺｈａｎｇＫａｉｘｕｅ，ＲｅｎＷｅｉｃｈａｏ，ＹａｎＳｏｎｇ，ＬｉｕＺｈｅｎｐｅｎｇ，ＸｕＪｉａｏ，ＬｉｕＸｉｕｂｏ，ＭａＷｅｉ（ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｈｅｉ ｌｏｎｇｊｉａｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅ，Ｈａｒｂｉｎ１５００４０，Ｃｈｉｎａ） ＡＢＳＴＲＡＣＴ　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：ＴｏｐｒｅｄｉｃｔｔｈｅｇｅｎｅｏｆＡｃｔｉｎｉｄｉａａｒｇｕｔａＧＤＰＬｇａｌａｃｔｏｓｅｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｓｅ（ＧＧＰ）ｂｙｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃｃｌｏｎｉｎｇｔｅｃｈ ｎｏｌｏｇｙ．Ｍｅｔｈｏｄｓ：ＡｃｔｉｎｉｄｉａｄｅｌｉｃｉｏｓａＧＧＰｓｅｑｕｅｎｃｅｗａｓｕｓｅｄａｓｔｈｅｐｒｏｂｅｓｅｑｕｅｎｃｅ，ａｎｄｂａｓｅｄｏｎｔｈｅＥＳＴｓｅｑｕｅｎｃｅｓｆｒｏｍＮＣＢＩ， ｓｏｍｅｃｈａｒａｃｔｅｒｓｏｆＧＧＰｐｒｏｔｅｉｎｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄａｎｄｐｒｅｄｉｃｔｅｄｂｙｔｈｅｔｏｏｌｓｏｆｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｎｄａｓｓｅｍｂｌｅｄｂｙＣＡＰ３ｓｅｑｕｅｎｃｅａｓｓｅｍｂｌｙ ｐｒｏｇｒａｍ．Ｒｅｓｕｌｔｓ：ＴｈｅｃｏｄｉｎｇｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆＡｃｔｉｎｉｄｉａａｒｇｕｔａＧＧＰｇｅｎｅｗａｓ１８６６ｂｐｃｏｎｔａｉｎｉｎｇａ１３５３ｂｐＯＲＦ，ｗｈｉｃｈｅｎｃｏｄｅｄ４５０ａ ｍｉｎｏａｃｉｄｓ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ：Ｔｈｅｓｔｕｄｙｐｒｏｖｉｄｅｓｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌａｎｄｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌｂａｓｉｓｆｏｒｔｈｅｅｘｐｌａｎａｔｉｏｎｏｆｇｅｎｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｆｕｎｃｔｉｏｎ． ＫＥＹＷＯＲＤＳ　Ａｃｔｉｎｉｄｉａａｒｇｕｔａ；ＧＤＰＬｇａｌａｃｔｏｓｅｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｓｅ；Ｉｎｓｉｌｉｃｏｃｌｏｎｉｎｇ；Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ 　　电子克隆（Ｉｎｓｉｌｉｃｏｃｌｏｎｉｎｇ）是近年来伴随着基 验克隆提供精准的参考序列等优点［１～３］。抗坏血酸 ＥＳＴ 。 （ＡｓＡ） ， 因组计划和 计划发展起来的基因克隆方法 是植物体最主要的水溶性抗氧化物质 可直 、 、 ，