松墨天牛转铁蛋白基因克隆及生物信息学分析-广东农业科学.PDF

广东农业科学… … … … … … … ……2016，43（4）：117-123 Guangdong…Agricultural…Sciences………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… doi：10.16768/j.issn.1004-874X.2016.04.023 蔡紫玲，刘琪司，林同.…松墨天牛转铁蛋白基因克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学，2016，43（4）：117-123. 松墨天牛转铁蛋白基因克隆及生物信息学分析 蔡紫玲，刘琪司，林  同 （华南农业大学林学与风景园林学院，广东…广州………510642） 摘  要：转铁蛋白是一类非血红素结合铁的β1–球蛋白，广泛分布于脊椎动物和无脊椎动物体内。克 隆了松墨天牛转铁蛋白基因（登录号：KU213914），命名为MaTf，其核苷酸序列全长为2…549…bp，包含一个 2178…bp的开放阅读框（ORF）和一个371…bp的带有加尾信号的3非编码区（3UTR）。采用生物信息学方法 分析MaTf的编码蛋白，结果显示：松墨天牛转铁蛋白分子量约为80…ku，等电点为7.36，为稳定蛋白，有信号 肽，不含跨膜结构域，有1个糖基化位点，有平均分布在整条肽链的43个磷酸化位点。二级结构多为随机卷 曲，仅有21.52%α螺旋，24%β片层（延伸链）结构，能形成三段卷曲螺旋，为亲水性蛋白，N端和C端各 有1个TR_FER结构域。 关键词：松墨天牛；转铁蛋白；生物信息学；结构域 中图分类号：S476.9；Q789………………………………………………文献标识码：A………………………………………………文章编号：1004-874X（2016）04-0117-07 Cloning and bioinformatics analysis of transferring  gene of Monochamus alternatus CAI…Zi-ling，LIU…Qi-si，LIN…Tong （College of Forestry and Landscap e Architecture ，South China Agricultural University ，Guangzhou 510642 ，China ） Abstracts ：Transferrin，a…non-heme…iron…beta1…globulin，is…widely…distributed…in…vertebrate…and…invertebrate… animals.…The…gene…of…transferrin…of…Monochamus alternatus…（GenBank…accession…number…is…KU213914）…was…cloned…and… named…as…MaTf…in…this…study.…The…whole…length…of…MaTf…was…2…549…bp，including…2…178…bp…open…reading…frame…（ORF）…and… 371…bp…non-encoding…region…with…a…tail…signal.…Bioinformatics…methods…were…used…to…analyze…the…characteristics…of…MaTf.… The…results…showed…that…MaTf…was…a…stable…protein…with…molecular…weight…of…80…ku…and…isoelectric…point…of…7.36.…There…was… a…signal…peptide，one…glycosylation…site，and…43…phoshorylaton…sites…in…MaTf.…The…transmembrane…domain…structure…was… not…found