Seqmore有参转录组结题报告.PDFVIP

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2019-02-15 发布于天津
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Seqmore有参转录组结题报告.PDF

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Seqmore有参转录组结题报告

合同编号： Seqmore有参转录组结题报告转录组分析项目（有参）客户：项目负责人：联系邮箱： project@ 联系电话： 028 年月日 2 目录一、工作流程3 1.1测序实验流程3 1.2 数据分析流程4 二、项目结果解读5 2.1 原始测序数据说明5 2.2 原始测序数据质控5 2.3 与参考基因组比对6 2.4 比对结果可视化7 2.5 基因表达分析8 2.6 样品间的聚类10 2.7RNA-seq 整体质量评估10 2.7.1 测序饱和度分析10 2.7.2 基因覆盖度分析11 2.8 表达差异分析12 2.9 差异基因注释14 2.9.1 GO 14 差异基因注释 2.9.2 差异基因KEGG注释14 2.10 差异基因富集分析15 2.10.1 GO 15 差异基因富集分析 2.10.2 GO 16 差异基因有向无环图 2.10.3 差异基因KEGG 富集分析17 2.11 表达模式聚类18 2.12 可变剪切分析19 2.13 新转录本预测20 2.14 SNP 分析21 2.15WGCNA 共表达网络分析21 2.16 蛋白网络构建及分析(PPI)22 三、附录23 3.1常用数据库及专用名词介绍23 3.2 文件解压缩方法24 3.3 文件打开或浏览方法25 3 一、工作流程 1.1测序实验流程 TM 针对真核生物，我们采用IlluminaTruseq RNA sampleprep Kit 方法构建文库，其流程如下图所示：试剂与仪器表实验步骤试剂仪器名称厂商总RNA 提取 TRIzol®Reagent Invitrogen （植物组织RNA 提取）（PlantRNAPurificationReagent）