基于NP问题的分子算法的研究应用数学专业论文.docxVIP

中北大学学位论文 中北大学学位论文 基于 NP 问题的分子算法的研究 摘要 DNA算法是一种模拟DNA分子结构并借助生物分子技术新的计算方法.分子计算这 一全新学科逐渐的发展,它在解决数目巨大的并行计算方面和NP完全问题方面优势的明 显的. 1994 年, Adleman 首次借助试管实验成功地用分子算法求解出七节点的哈密顿路径 问题.DNA 算法的实验操作过程是: DNA 分子结构为双螺旋结构并且碱基互补配对,所以 可以把计算对象映射成 DNA 分子链,在酶的催化作用下,形成不同的数据池,再把初始数 据映射成容易控制的生化操作.最终使用聚合链反应 PCR,超声波降解,亲和层析,克隆,诱 变,分子纯化,电泳,磁珠分离等检测运算结果. 本文分三部分研究DNA算法在解决NP-完全问题方面的应用. 第一部分给出了单约束非 0-1整数背包问题的 DNA计算方法,即对变量取值进行 DNA编码并形成所有可能解；用批接入实验,电泳实验得到最优解;通过检测实验输出所 有最优解.并例证此算法的可行性. 在第二部分中,由于Adleman和Lipton的开创性工作,最近DNA计算引起了人们的极 大兴趣,他们提出的分子算法解决了图形的表示方法,但是没有给出如何处理图中节点的 弧线的信息.本文的目的是通过提出在图中城市间的距离用简单的弧线代表 ,延伸了 Adleman和Lipton提出的基本的分子算法.并提出只有当算法步骤由当前的需要人工干预 被可执行的可在试管中操作的DN瞄代替,解决计算难题的真正可行DNA计算可以实现. 第三部分给出了一种新的计算模型求解最短路径问题. 关键词: DNA计算, DNA编码,粘贴模型 The research of molecular algorithm based on NP problems Abstract DNA algorithm is a new method that simulates the molecular structure of DNA with the help of biological molecules. Molecular algorithm as a new discipline develops gradually. The advantage of resolving the number of huge parallel computing and NP-complete problems is obvious. In 1994, Adleman for the first time successfully a seven-node solved Hamiltonian path problem using molecular algorithm through test-tube experiments. The experimental procedu re of DNA algorithm is: As the molecular structure of DNA double helix and nucleotides match, so we can map the object to DNA strands. Enzyme catalysis forms different data pool, then the initial data maps to a biochemical operation that is easy to control. Finally using pol- ymerization chain reaction ultrasonic degradation ,hybridization ,clone,trap,molecules puff, electrophoresis, magnet-bead separate and so on ,detect the result of the reaction． This article is divided into three parts introduced DNA algoritm for solving NP-complete problems. The first part gives a method to solve single restriction not 0-1 integer knapsack problem with DNA computation. DNA encoding for all values of any variable were applizd and all possible solutions were synthesi