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关于DNA甲基化与疾病关系调研报告 第 PAGE \* Arabic \* MERGEFORMAT 17 页第 PAGE \* Arabic \* MERGEFORMAT 17 页 关于DNA甲基化与疾病关系分析 调研报告 学生姓名： 张文静 学 院： 信息科学与工程学院 专业班级： 计算机1603班 目录 TOC \o 1-2 \h \z \u HYPERLINK \l _Toc7686 研究背景 PAGEREF _Toc7686 3 HYPERLINK \l _Toc11751 1. 定义 PAGEREF _Toc11751 3 HYPERLINK \l _Toc17815 2. 特征 PAGEREF _Toc17815 5 HYPERLINK \l _Toc12796 1. 研究意义 PAGEREF _Toc12796 7 HYPERLINK \l _Toc30238 数据与技术 PAGEREF _Toc30238 8 HYPERLINK \l _Toc25270 1. 数据库 PAGEREF _Toc25270 8 HYPERLINK \l _Toc13091 2. 检测原理 PAGEREF _Toc13091 8 HYPERLINK \l _Toc31664 3. 测序技术 PAGEREF _Toc31664 11 HYPERLINK \l _Toc16192 疾病关联研究 PAGEREF _Toc16192 12 HYPERLINK \l _Toc31962 1. 甲基化与疾病关系 PAGEREF _Toc31962 12 HYPERLINK \l _Toc19293 2. 分析方法 PAGEREF _Toc19293 13 HYPERLINK \l _Toc10577 研究热点 PAGEREF _Toc10577 14 HYPERLINK \l _Toc21680 参考文献 PAGEREF _Toc21680 15  研究背景 定义 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科。表观遗传的现象很多，已知的有DNA甲基化（DNA methylation），基因组印记（genomic imprinting），母体效应（maternal effects），基因沉默（gene silencing），核仁显性，休眠转座子激活和RNA编辑（RNA editing）【DNA甲基化、组蛋白修饰、RNA调控（干扰、microRNA、long non-coding RNA）】等。 DNA甲基化（DNA methylation）是最早发现的修饰途径之一，大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。 DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下， 在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5碳位共价键结合一个 甲基基团。正常情况下，人类基因组“ 垃圾”序列的CpG二核苷酸相对稀少，并且总是处于甲基化状态，与之相 反，人类基因组中大小为100—1000 bp 左右且富含CpG二核苷酸的CpG岛则总是处于未甲基化状态，并且与56% 的人类基因组编码基因相关。人类基因组序列草图分析结果表明， 人类基因组CpG岛约为28890个，大部分染色体每1 Mb就有5—15个CpG岛，平均值为每Mb含10.5个CpG岛，CpG岛的数目与基因密度有良好的对应关系[9]。 由于DNA甲基化与人类发育和肿瘤疾病的密切关系， 特别是CpG岛甲基化所致抑癌基因转录失活问题，DNA甲基 化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容。 甲基化 哺乳动物一生中DNA甲基化水平经历2次显著变化，第一次发生在受精卵最初几次卵裂中，去甲基化酶清除了DNA分子上几乎所有从亲代遗传来的甲基化标志；第二次发生在胚胎植入子宫时，一种新的甲基化遍布整个基因组，甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式。细胞内新的甲基化模式一旦建成，即可通过甲基化以“甲基化维持”的形式将新的DNA甲基化传递给所有子细胞DNA分子。 在甲基转移酶的催化下，DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成5－甲基胞嘧啶，这常见于基因的5-CG-3序列。大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶，主要集中在基因5端的非编码区，并成簇存在。甲基化位点可随DNA的复制而遗传，因为DNA复制后，甲基化酶可将新合成的未甲基化的位点进行甲基化。DNA的甲基化可引起基因的失活，DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化，从而影响了蛋白质与DNA的相互作用，甲基化达到一定程度时会发生从常规的B-DNA向Z-DNA的过渡，由