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模糊聚类分析 第三步 聚类(求动态聚类图) 传递闭包法: 传递闭包是包含R的最小的传递关系 1) 若R为模糊相似矩阵,则对任意的k,Rk也 是模糊相似矩阵 性质: 2) 模糊相似矩阵R都存在传递闭包t(R)=Rk,对任意lk,都有Rl=Rk 3)t(R)=Rk为模糊等价矩阵 模糊聚类分析 加速算法: 这样传递闭包的矩阵得到的聚类是模糊相似矩阵R的聚类吗?构造传递闭包的方法,相对R发生多大的变化,保持R多少信息? 问: 模糊聚类分析 总 结: 聚类 等价关系 相似关系 因为从相似到等价的计算量太大,所以产生了 直接聚类法、 编网法、 最大树法 等等 问题 人类基因组中的DNA全序列是由4个碱基A,T,C,G按一定顺序排成的长约30亿的序列,毫无疑问,这是一本记录着人类自身生老病死及遗传进化的全部信息的“天书”。但是,除了这四种碱基外,人们对它所包含的内容知之甚少,如何破译这部“天书”是二十一世纪最重要的任务之一。 2000A:DNA序列分类 问题 在这个目标中,研究DNA全序列具有什么结构,由这4个字符排成的看似随机的序列中隐藏着什么规律,又是解读这部天书的基础,是生物信息学(Bioinformatics)最重要的课题之一。虽然人类对这部“天书”知之甚少,但也发现了DNA序列中的一些规律性和结构。 问题 例如,在全序列中有一些是用于编码蛋白质的序列片段,即由这4个字符组成的64种不同的3字符串,其中大多数用于编码构成蛋白质的20种氨基酸。又例如,在不用于编码蛋白质的序列片段中,A和T的含量特别多些,于是以某些碱基特别丰富作为特征去研究DNA序列的结构也取得了一些结果。 问题 此外,利用统计的方法还发现序列的某些片段之间具有相关性,等等。这些发现让人们相信,DNA序列中存在着局部的和全局性的结构,充分发掘序列的结构对理解DNA全序列是十分有意义的。作为研究DNA序列的结构的尝试,试对以下序列进行分类: 问题 问题 问题一:下面有20个已知类别的人工制造的序列(见附件1),其中序列标号1—10 为A类,11-20为B类。请从中提取特征,构造分类方法,并用这些已知类别的序列,衡量你的方法是否足够好。然后用你认为满意的方法,对另外20个未标明类别的人工序列(标号21—40)进行分类,把结果用序号标明它们的类别(无法分类的不写入): A类 ; B类 。 问题 问题二:请对 182个自然DNA序列(/mcm00/problems.htm)进行分类。它们都较长。用你的分类方法对它们进行分类,并给出分类结果。 看了这道题,我们应当从何处入手呢,我们应该怎样进行分析呢…… * 数学建模暑期集训 模糊聚类分析 数学教研室 向长城 Fuzzy Clustering Analysis  数学建模常用方法:微分方程、概率统计、图论、数学规划等,而模糊数学方法的运用就相对较少。 模糊数学是1965年由美国控制论专家L. A. Zadeh创立的,是一种较新的理论。 造成这种现象的主要原因是: 第一,在灰色问题和黑色问题中有很多现象是用“模糊”的自然语言描述的。在这种情况下, 用模糊的模型也许更符和实际。 第二, 数学建模活动的目的之一是培养学生的创新精神。用新理论、新方法解题应该受到鼓励。 引入数学建模课堂的必要性: 聚类分析: 利用给定的指标对事物进行分类 模糊聚类分析: 将模糊数学方法用于聚类分析 模糊聚类分析的应用: 医学、气象预报、地质、农业、林业等方面。 模糊聚类的思想:如同模式识别通过贴近度评判,模糊聚类分析通过模糊等价关系评判. 依据:在经典集合具有等价关系的两元素可以视 为一类 1.什么是模糊(Fuzzy) 个头超过180cm的人 {p|p(age)180cm}=B 大高个子 B’ 问:180cm属于B? 180cm属于B’? 预备知识 现在的问题是:有些集合,某元素是否属于它是不确定的,模模糊糊的。 传统的集合,某元素是否属于该集合是确定的:或是或否? 以模糊集合为基础,用精确的数学方法研究和处理模糊性和模糊现象的科学,其目标就是对不确定性进行量化的处理。 模糊数学: 预备知识 如:年轻、重、热、美、厚、薄、快、慢、大、小、高、低、长、短、贵、贱、强、弱、软、硬、阴天、多云、暴雨、清晨、礼品等。 1.模糊集合 定义:设在论域U

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