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标本数字化:
数据、技术与服务
许哲平
中科院文献情报中心
xuzp@
提纲
• 生物多样性信息学思考及相关案例
• 三维扫描(打印)技术
• 中国民族药用植物整合平台
可整合的外部资源
•物种2000 中国节点 •GBIF,全球最大 •CFH (中国自然标本馆
•The Plant List •NSII (国家标本资源共享平台) •PPBC (中国植物图像库)
•物种2000全球节点 •iDigBio,北美最大标本平台 •中国鸟网
•Atlas of Living Australia •科学数据库中的生物图像
• International Plant Names
•CForBio SinoBON •EOL (Encyclopedia of Life)
Index (IPNI) •Global Plants on JSTOR
•澳大利亚植物图像索引
•植物志 •科技基础条件平台科学数据 •美国农业部植物图像集
•动物志 库
•Wikispecies ,wikipedia “3S” 数据资源
名录 标本观测 图像
GPS :传感器、无人
机、内置定位装置
GIS :GIS 图层和GIS
服务:WMS 、TMS
• BHL (生物多样性历史文 • Barcode of Life Data Systems • 澳门生物多样性数据中心 RS:近地面遥感数
献图书馆) • NCBI • 香港农业、渔业和保护部
• BHL中国节点 • 中国西南野生生物种质资源 • 台湾GBIF节点 据(如LIDAR数据等)
库 • 四川省自然科技资源共享平
•eF在线植物志项目
• 中国珍稀濒危植物DNA条形 台
• 中国植物志在线版 码 • 广西植物资源信息共享平台
• 中国动物志在线版 • 中药材DNA条形码鉴定系统
文献 DNA序列 地方资源
我们的阶层
完整性和整体性设计
当前分类学数据
大背景:90% 的科学数据都是近3年产生的。
困难和出路
生态系统的“生态系统”
瓶颈和OpenFAIR
OSF :Open Science Framework
开放科研框架
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