紫红笛鲷线粒体全序列与笛鲷属鱼类分化年代的贝叶斯分析-海洋科学.PDF

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2019-02-22 发布于天津
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紫红笛鲷线粒体全序列与笛鲷属鱼类分化年代的贝叶斯分析-海洋科学.PDF

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紫红笛鲷线粒体全序列与笛鲷属鱼类分化年代的贝叶斯分析廖杰, 王中铎, 郭昱嵩, 刘楚吾 ( , 524025) 摘要: 利用常规 PCR 未纯化产物直接测序的方法, 获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)全长为 16 543 bp 线粒体 DNA 全序列, GenBank 登录号为 JN182927 。结合 GenBank 中的已有数据比较分析表明: 紫红笛鲷与笛鲷属(Lutjanus)线粒体基因组成基本一致, 符合脊椎动物的特征, 各基因间进化速率差异显著; 13 个蛋白编码基因拼接序列贝叶斯建树的后验率显著高于单基因或全序列, 更适用于笛鲷属的贝叶斯法系统分化分析和年代推断; 13 个蛋白编码基因及其拼接序列进行的系统进化分析均支持紫红笛鲷与勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)及海鸡母笛鲷(Lutjanus rivulatus) 亲缘关系较近; 基于 13 个蛋白编码基因拼接序列的贝叶斯松散分子钟推算出笛鲷属鱼类两个主要支系大约在 61.5Ma 前古新世的达宁阶与蒙蒂阶交界时期发生分化。关键词: 紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus); 线粒体全序列; 贝叶斯分析; 松散分子钟; 笛鲷属鱼类中图分类号: Q349 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2013)01-0062-08 [7-8]  (Lutjanus argentimaculatus) , (Osteichthyes), (Perciformes), , (Lutjanidae), (Lutjanus) , [9-11] , , , , [1] , [2] [12-14] ; [3] Russell [4] [6,11,13] [5-6] Guo (COX 2 Cyt b) , , : DNA(mtDNA) Guo [5] (COX 2 Cyt b) (Lutjanus