肉鸭养殖过程中发酵床垫料菌群结构变化的研究-微生物学报.PDF

微生物学通报 Jul. 20, 2015, 42(7): 1263−1270 Microbiology China © 2015 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.140784 研究报告 肉鸭养殖过程中发酵床垫料菌群结构变化的研究 章小婷 郑卫江 林勇 袁婧 姚文* (南京农业大学 消化道微生物研究室 江苏 南京 210095) 摘 要：【目的】探究发酵床使用时间和肉鸭粪便微生物对发酵床垫料菌群结构、总菌和大肠杆 菌数量的影响。【方法】采集江苏某肉鸭发酵床养殖场内刚制作完成的发酵床垫料样品，及其饲 养4 批次、8 批次后的垫料样品，同时采集各批次 34 日龄肉鸭粪便样品，采用变性梯度凝胶电 泳技术(Denaturing gradient gel electrophoresis ，DGGE) 、16S rRNA 基因序列分析和实时荧光定量 PCR (Quantitative real-time PCR)技术对发酵床使用过程中垫料菌群结构进行定性和定量研究。 【结果】0 批次(D0)与4 批次(D4)、8 批次(D8)垫料菌群相似性分别为68.81%、70.82% ，而4 批 次与8 批次间垫料菌群的相似性则达81.93%，显著高于D4 、D8 与D0 间相似性(P0.05) 。条带 6、8 (最相似菌分别为Leqionella tunisiensis、Pedobacte bauzanensis)在3 个时间点垫料菌群中均 表现优势，且含量较为稳定；条带 10 (最相似菌为Rummeliibacillus suwonesis)仅在2 个重复使用 垫料菌群中表现优势；条带 12 、13 (最相似菌分别是 Psychrobacter sp. PRwf-1 、Iamia majanohamensis)共同存在于垫料样和粪便样。肉鸭粪便中大肠杆菌的数量显著高于4 批次、8 批 次垫料中的数量(P0.05) ，与0 批次垫料间差异不显著(P0.05) 。【结论】使用时间和肉鸭粪便微 生物共同影响了发酵床垫料菌群结构和数量，菌群结构随使用时间的延长而趋于稳定。 关键词：发酵床，肉鸭，细菌种群，变性梯度凝胶电泳技术，实时荧光定量PCR Succession of bacterial community in duck bio-bed over time * ZHANG Xiao-Ting ZHENG Wei-Jiang LIN Yong YUAN Jing YAO Wen (Laboratory of Gastrointestinal Microbiology , Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095, China) Abstract: [Objective] This study aimed to character the succession of bacterial community in the litter during the fermentation of duck bio-bed. [Methods] The experiment was conducted in one meat duck