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摘要目的:
摘要
目的:
金黄色葡萄球菌(金葡菌)(Staphylococcus auFeus,口ureuS) 是引起社区感染和医院感染的主要病原菌之一。随着广谱抗生素及 免疫抑制剂等的广泛应用,&aureus抗生素的耐药现象日益严重, 己遍布引起医学界极大关注。目前&aureus对万古霉素的耐药机制 尚未清楚。本文建立及优化细菌膜蛋白的提取方法,同时通过应用 蛋白质组学技术对金葡菌万古霉素耐药株(vancomycin.resistant
Saureus,VRSA)和敏感株(Methicillin-resistant S.aureus,MRSA)
膜蛋白质组之间的差异进行研究分析,鉴定差异点蛋白质,为研究 膜蛋白与S.aureus对万古霉素耐药之间的关系,具有重要的现实意 义。
方法:
1.细菌膜蛋白提取方法的建立及优化
将MRSA接种于M-H肉汤培养基,离心收集菌体。利用一步法及 三步法提取MRSA膜蛋白质,分别用Bradford法测定相应样品蛋白 质浓度,并行2一DE和图像分析。
2.金葡菌万古霉素耐药株膜蛋白质的研究 (1)临床MRSA为我院检验科标本,共收集16株。按照NCCLS
标准,应用琼脂平板稀释法及MRSA特异性基因mecA的扩增鉴定
MRSA,诱导产生5株万古霉素耐药株。此外师妹代洪还赠送3株
VRSA。
(2)提取膜蛋白质
①经SDS—PAGE分析OMP的成分,凝胶分光光度扫描仪测定膜蛋
白的相对含量。
②以pH3~10预制胶条等电聚焦为第一向,等电聚焦结束后在平 衡液中平衡30分钟后,再以SDS为第二向进行2-DE,再分离蛋 白质,脱胶,固定,敏化银染,显影,ImageScanner扫描,ImageMaster 2D E1 ite3.01软件分析凝胶蛋白质图谱,比较VRSA和敏感株膜蛋白 质凝胶图谱,分析差异表达的蛋白质。同时建立一个能正确区分VRSA 和MRSA的膜蛋白质组模式,应用VRSA膜蛋白质组模式在双盲法条
件下检测3张VRSA和16张MRSA膜蛋白质凝胶图谱。3.质谱分析
件下检测3张VRSA和16张MRSA膜蛋白质凝胶图谱。
3.质谱分析
(1)MALDI—TOF肽质量指纹图谱
(2)蛋白质数据库搜索
结果:
1.利用一步法及三步法提取MRSA膜蛋白质,并用Bradford法测 定三步法样品蛋白质浓度为629.25±5.60 u g/m1,一步法为 215.00±6.90 u g/ml。同时应用ImageScanner扫描2-DE图谱, ImageMaster 2D E1 ite 3.01软件对一步法及三步法提取MRSA膜蛋白 质2一DE图谱进行分析。发现三步法提取MRSA膜蛋白质图谱平均每张蛋 白斑点数为980±15.7个,一步法为706±11.4个。
2.
(1)MRSA和金葡菌ATCC25923膜蛋白质图谱与VRSA相比,发 现凝胶上分子量为45KD、43KD、30KD、20KD、14KD的条带较VRSA 清晰,分子量为45KD和14KD的膜蛋白的相对含量较VRSA多。
(2)MRSA膜蛋白质图谱平均每张蛋白斑点数为920±20.8个, VRSA为760-4-26.6个,大部分蛋白质点主要分布在分子量为 30KI)~97KD,等电点用4~9的区域。当某一蛋白质点在某一类型组织 凝胶中表达较其他类型组织凝胶明显增强(校正后蛋白质点的表达 量相差3倍以上),并在不少于50%的该类组织凝胶图谱中表达,视 其为差异蛋白质点。MRSA VS VRSA,在MRSA膜蛋白质凝胶图谱中发 现13个差异蛋白质点,在VRSA膜蛋白质凝胶图谱中发现差异蛋白 质点15个。
(3)发现一个由6个蛋白质点组成的VRSA膜蛋白质2一DE图谱
模式。16张MRSA膜蛋白质2一DE图谱中,全部得到正确诊断,3张 VRSA膜蛋白质2一DE图谱,有3张得到正确诊断,灵敏度为100%, 特异性为i00%。
3.差异蛋白质点的鉴定
(1)选取上述差异蛋白质点进行MS分析,获得18张PMF,初 步鉴定了其中的9张PMF。其中PyrR双功能蛋白 (PyrR bifunctional protein)、蛋白SAV0289(protein SAV0289)、 Orf保守蛋白(Orf conserved protein)、IS605/IS200转座酶
(IS605/IS200—1ike transposase)等4个蛋白质点在VRSA 2-DE
凝胶图谱中表达明显增高。多谷氨酸合成蛋白(Poly—gamma-glutamate
凝胶图谱中表达明显增高。多谷氨酸合成蛋白
(Poly—gamma-glutamate synthesiS protein,PgsA)、蛋白MWl201 (protein MWl201)、表面蛋白C(surfac
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