基于拓扑势加权的动态PPI网络复合物挖掘方法-电子学报.PDFVIP

第１期 电　　子　　学　　报 Ｖｏｌ．４６　Ｎｏ．１ ２０１８年１月 ＡＣＴＡＥＬＥＣＴＲＯＮＩＣＡＳＩＮＩＣＡ Ｊａｎ．　２０１８ 基于拓扑势加权的动态ＰＰＩ网络复合物挖掘方法 １ １ ２ 雷秀娟 ，高　银 ，郭　玲 （１．陕西师范大学计算机科学学院，陕西西安７１０１１９；２．陕西师范大学生命科学学院，陕西西安７１０１１９） 　　摘　要：　从动态蛋白质相互作用（ＰＰＩ）网络中挖掘蛋白质复合物是当前复合物挖掘研究的一个热点，但是目前 大都采用未加权网络进行聚类分析，由于不能准确地描述网络的拓扑特性，因此其正确率不高．鉴于此，本文提出采用 拓扑势场的方法来构造加权网络，网络中的每一个蛋白质都被视作一个物理粒子，在它周围存在一个虚拟的作用场， 由此网络中所有蛋白质的相互作用联合形成一个拓扑势场，文中定义了结点间的