课件：动物遗传标记及其数据处理.ppt

水牛network Fumihito分析了原鸡与家鸡mtDNA序列，认为全世界的家鸡是单起源的，起源于泰国及其邻近地区的红色原鸡，然后家鸡在该地驯化后向北传入中国。这与达尔文家鸡单起源于红色原鸡的观点一致。 家禽起源 中国12个地方鸡种线粒体DNA D-loop多态性研究 研究了中国12个地方鸡种线粒体DNA控制区第一高变区序列的变异情况。结果表明在所测定的544 bp序列,界定了16种不同的单倍型。系统树表明，中国地方鸡种有5个母系祖先；中国地方鸡种与4种原鸡的单倍型系统树表明，中国地方鸡种与红原鸡gallus亚种及大陆上各地的spadiceus亚种亲缘关系极近，提示它们是中国地方鸡种的起源祖先。 Beja从52个国家采集427头家驴，10头奴比亚野驴、索马里野驴、亚洲野驴，对其mtDNA序列进行分析，表明家驴起源于非洲野驴。雷初朝首次从分子水平证实中国家驴可能起源于非洲野驴，而与亚洲野驴无关。 驴的非洲起源 中国驴的起源 山羊mtDNA起源 Luikart分析了世界各地的88个山羊品种的406个个体的mtDNA控制区481bp的序列，结果表明，家养山羊有3个高度分化的支系(lineages A, B, C ) ，其中有两个支系( A and B)在所有品种中广泛存在(超过90%的样本个体都聚集在支系A, B)，有一个支系(C)仅存在于东亚和南亚的山羊中。说明家养山羊和牛、绵羊和猪的系统进化相似，有多个母系起源，其中一个起源中心可能在亚洲的肥沃的新月形地区(Fertile Scrent)。但该试验仅采了中国中卫山羊(1只)和新疆山羊(1只) 。 Joshi对10个印度山羊363个个体HVRI 457bp序列，获得了200种单倍型，发现5个支系（A、B、C、D和E），其中D和E是首次报道，即5个母系起源。反映出印度山羊具有丰富的遗传多样性。 印度山羊mtDNA起源 印度山羊起源 绵羊起源 Hiendleder对欧洲、非洲、亚洲的家绵羊和摩佛伦羊、乌利尔羊、盘羊等野羊的mtDNA进行分析，发现20种单倍型，分属于3个系统发育集团(乌利尔羊／盘羊、摩佛伦羊／家绵羊、家绵羊)，而对摩佛伦羊和家绵羊集团的进一步分析，可把其划分为2个明确的支系：欧洲支系和亚洲支系。其中，欧洲支系包括绝大多数欧洲家绵羊和摩佛伦羊的单倍型，亚洲支系包括从中亚和部分欧洲绵羊的单倍型。他认为现代家绵羊与欧洲摩佛伦羊均源于一个共同的始祖，认为家绵羊存在另一个野生始祖，但不是乌利尔羊和盘羊。 Lau对亚洲水牛mtDNA进行分析，发现沼泽型水牛和江河型水牛起源于一个沼泽类动物，很可能代表现在的亚洲野水牛Bubalus arnee。提出亚洲野水牛起源于东南亚大陆，向北传播到中国，向西传播到印度次大陆，而印度次大陆是江河型水牛进化和驯化的地方。沼泽型水牛在中国驯化后，通过2条路线传播，第一，从台湾和菲律宾传向东部岛屿，第二，从东南亚大陆向南传播到印度尼西亚西部诸岛。 亚洲水牛的mtDNA起源 研究动物的起源、演化与分类 由于mtDNA结构简单、稳定、单性母性遗传方式，在世代传递过程中没有重组，驯化了的家畜一般能保持其野生祖先mtDNA类型。而且它不受外来公畜杂交改良的影响，样品来源比较容易。因此，mtDNA作为一个可靠的母性遗传标记将广泛用于家畜种及品种的起源、演化和分类的研究。 mtDNA在不同种间、种内不同群体间具有广泛多态性，根据mtDNA RFLP和序列，尤其D-loop区的异同，可以研究家畜品种的起源进化以及亲缘关系。 目前，mtDNA的RFLP技术和D-loop的序列分析己成为研究亲缘关系较近的物种间和种内不同群体间遗传分化的有力工具。 用mtDNA研究动物的群体结构 家畜mtDNA的RFLP和核苷酸歧异度都能表示群体的一些特征，而且mtDNA没有重组，更能直观的保存群体突变。因此，mtDNA对研究近缘种的畜群遗传结构有一定的意义，对研究畜群的历史性地理分布具有重要参考价值。 mtDNA与家畜生产性能的关系 目前，大量的研究表明哺乳动物mtDNA基因中的突变并非总是中性的。因此，与mtDNA本质上密切相关的胞质效应，特别是mtDNA的多态性与家畜生产性能的关系，自然是畜牧学者关注的重要方面，相关的研究已有报道。 Beottcher认为Holstein牛的12S rRNA基因中，1个核苷酸的转换可显著降低奶牛的乳脂率。Hiendleder通过分析认为绵羊rRNA中的核苷酸颠换可能具有某种表型效应。Brown等用mtDNA解释细胞对生产性能影响的遗传效应。然而，mtDNA与家畜生产性能的关系需要进一步的研究，才能作为家畜选种的一个有用的遗传标记。 Bell等报道细胞质遗传效应影响奶牛产奶量、乳脂率。他认为细胞