蛋白质与dna的下相互作用.pptVIP

分类： 与单链RNA结合 与茎环结构结合 与双链DNA结合：普遍性结合 特异性结合 蛋白质与DNA结合的特性： 1.DNA识别部位有二度对称性。蛋白质一般是有二度对称结构的二聚体，两个单体具有旋转对称性，与硷基的旋转对称吻合。 2.蛋白质和DNA的接触区只在DNA的一侧。 3.在结合过程中，蛋白质和DNA都有构像改变。 4.普遍性结合：蛋白质中带正电荷氨基酸与DNA骨架的磷酸基团形成离子键。 5. 特异性结合：识别螺旋区内氨基酸与DNA特定硷基接触。 蛋白质与DNA的普遍性结合中DNA特点： 蛋白质与DNA主链骨架接触，大多数涉及磷酸二酯键中的氧原子。 与DNA硷基序列特异性无关 结构的匹配性： 旋转对称性 特定距离的相反电荷 形成氢键基团排布上的匹配 形成足够大的范德华力 1.蛋白质和DNA都存在0.7nm 的重复距离 DNA双螺旋单链相邻磷酸基团间的距离是0.7nm。 β—折叠，N原子间距离是0.7nm 伸展β—折叠Cβ间距离是0.7nm α—螺旋，Arg和Lys被另外三